Apaf-1
Estructures disponibles | |
---|---|
PDB | Cerca ortòloga: PDBe ![]() ![]() |
Llista de codis id de PDB | 1C15, 1CWW, 1CY5, 1Z6T, 2P1H, 2YGS, 3J2T, 3YGS, 4RHW i 3JBT ![]() |
Identificadors | |
Ontologia genètica | |
Funció Molecular | heat shock protein binding (en) ![]() ADP binding (en) ![]() unió proteica unió de proteïnes idèntica Unió d'ATP unió de nucleòtids cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process (en) ![]() ![]() |
Component Cel·lular | citoplasma citosol exosoma extracel·lular nucli cel·lular apoptosome (en) ![]() regió extracel·lular secretory granule lumen (en) ![]() ficolin-1-rich granule lumen (en) ![]() citosol complex macromolecular apoptosome (en) ![]() exosoma extracel·lular ![]() |
Procés biològic | cellular response to transforming growth factor beta stimulus (en) ![]() neuron apoptotic process (en) ![]() regulation of apoptotic process (en) ![]() diferenciació cel·lular response to hypoxia (en) ![]() response to nutrient (en) ![]() response to G1 DNA damage checkpoint signaling (en) ![]() envelliment humà positive regulation of apoptotic signaling pathway (en) ![]() glial cell apoptotic process (en) ![]() desenvolupament neuronal desenvolupament d'organisme multicel·lular cardiac muscle cell apoptotic process (en) ![]() intrinsic apoptotic signaling pathway (en) ![]() intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress (en) ![]() neural tube closure (en) ![]() brain development (en) ![]() positive regulation of apoptotic process (en) ![]() apoptotic signaling pathway (en) ![]() forebrain development (en) ![]() regulation of apoptotic DNA fragmentation (en) ![]() protein homooligomerization (en) ![]() activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process (en) ![]() activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process by cytochrome c (en) ![]() apoptosi neutrophil degranulation (en) ![]() negative regulation of G0 to G1 transition (en) ![]() kidney development (en) ![]() activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process by cytochrome c (en) ![]() activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process by cytochrome c (en) ![]() ![]() |
Patró de l'expressió de l'ARN | |
Ortòlegs Humà | |
Ortòlegs Ratolí | |
UniProt | O14727 ![]() |
SeqRef (proteïna) | NP_001151, NP_037361, NP_863651, NP_863658, NP_863659 i XP_016874739 ![]() |
Substància | proteïna ![]() |
---|---|
Identificadors | |
Símbol | CED4 |
HUGO | 576 |
Entrez | 317 |
OMIM | 602233 |
RefSeq | NM_181861.1 |
O14727 | |
PDB | 1C15, 1CWW, 1CY5, 1Z6T, 2P1H, 2YGS, 3J2T, 3YGS, 4RHW i 3JBT ![]() |
La proteïna Apaf-1 (Apoptosis protease-activating factor-1) és un regulador clau de la via apoptòtica mitocondrial, sent l'element central del complex multimèric anomenat apoptosoma, format també per la procaspasa-9 i el citocrom c.
Les activitats Apaf es van descriure per primera vegada en experiments in vitro per recuperar l'activitat caspasa a partir de fraccions citosòliques de cèl·lules HeLa. Apaf-1 va resultar ser una molècula adaptadora amb homologia amb la proteïna CED-4 de C. elegans, mentre que Apaf-2 i Apaf-3 van ser identificats com el citocrom ci la caspasa-9 respectivament (Zou et al. 1997).
La formació de l'apoptosoma
La formació de l'estructura de l'apoptosoma es desencadena amb l'alliberament del mitocondri del citocrom c intervingut per la família Bcl-2. Un cop alliberat, el citocrom c s'uneix a Apaf-1 formant un primer complex. Aquesta unió ve definida per l'existència en l'extrem C-terminal d'Apaf-1 de diversos dominis WD40 d'unió proteïna-proteïna com els presents en la subunitat b de les proteïnes G heterotrimèriques. Apaf-1 presenta també un domini de reclutament de caspases (CARD) que, en condicions d'inactivitat, estaria "segrestat" per dos dels dominis WD40, però que s'allibera amb la unió del citocrom c. L'exposició dels dominis CARD permet a Apaf-1 reclutar la procaspasa-9 en presència de dATP que intervé l'oligomerització del complex. Un cop unida, la procaspasa-9 té un autoprocessament donant lloc a la seva forma activa de caspasa-9, una caspasa iniciadora capaç d'activar caspases efectores com la caspasa-3. Aquesta successió d'esdeveniments acaba desembocant en l'activació d'altres caspases i de factors de degradació d'ADN que s'encarregarien de fragmentar el material genètic.
Bibliografia
- Zou H, Henzel WJ, Liu X, Lutschg A, Wang X. Apaf-1, a human protein homologous to C. elegans CED-4, participates in cytochrome c-dependent activation of caspase-3. Cell 1997 Aug 8;90(3):405-13. PMID: 9267021.
- Yoshida H, Kong YY, Yoshida R, Elia AJ, Hakem A, Hakem R, Penninger JM, Mak TW. Apaf1 is required for mitochondrial pathways of apoptosis and brain development. Cell. 1998 Sep 18;94(6):739-50. PMID: 9753321.
- Danial NN, Korsmeyer SJ. Cell death: critical control points. Cell 2004 Jan 23;116 (2):205-19. PMID: 14744432.
Enllaços externs
- APAF1 (Apoptotic protease activating factor 1) Arxivat 2005-10-25 a Wayback Machine.