Dihydrouridine

Dihydrouridine

Structure de la 5,6-dihydrouridine
Identification
Nom UICPA 1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxyméthyl)oxolan-2-yl]-1,3-diazinane-2,4-dione
No CAS 5627-05-4
No ECHA 100.257.727
PubChem 94312
ChEBI 23774
SMILES
C1CN(C(=O)NC1=O)[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)CO)O)O
PubChem, vue 3D
InChI
Std. InChI : vue 3D
InChI=1S/C9H14N2O6/c12-3-4-6(14)7(15)8(17-4)11-2-1-5(13)10-9(11)16/h4,6-8,12,14-15H,1-3H2,(H,10,13,16)/t4-,6-,7-,8-/m1/s1
Std. InChIKey :
ZPTBLXKRQACLCR-XVFCMESISA-N
Propriétés chimiques
Formule C9H14N2O6  [Isomères]
Masse molaire[1] 246,217 3 ± 0,010 4 g/mol
C 43,9 %, H 5,73 %, N 11,38 %, O 38,99 %,

Unités du SI et CNTP, sauf indication contraire.
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La dihydrouridine (notée D ou UH2) est un ribonucléoside constitué de résidus de dihydrouracile et de ribose qu'on trouve dans les ARNm et les ARNt.

Sa conformation non planaire déstabilise la structure de l'ARN et augmente sa flexibilité, contrairement à la pseudouridine[2]. Cette particularité est utilisée par les organismes qui se développent à basse température pour préserver la fluidité de leurs structures biologiques[3].

Notes et références

  1. Masse molaire calculée d’après « Atomic weights of the elements 2007 », sur www.chem.qmul.ac.uk.
  2. (en) Joseph J. Dalluge, Takeshi Hashizume, Alan E. Sopchik, James A. McCloskey et Darrell R. Davis, « Conformational Flexibility in RNA: The Role of Dihydrouridine », Nucleic Acide Research, vol. 24, no 6,‎ , p. 1073-1079 (lire en ligne) DOI 10.1093/nar/24.6.1073 PMID 8604341
  3. (en) J J Dalluge, T Hamamoto, K Horikoshi, R Y Morita, K O Stetter et J A McCloskey, « Posttranscriptional modification of tRNA in psychrophilic bacteria », Journal of Bacteriology, vol. 179, no 6,‎ , p. 1918-1923 (lire en ligne) PMID 9068636
v · m
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