GTF3A

GTF3A
Identifiants
AliasesGTF3A
IDs externesOMIM: 600860 MGI: 1913846 HomoloGene: 55630 GeneCards: GTF3A
Position du gène (Homme)
Chromosome 13 humain
Chr.Chromosome 13 humain[1]
Chromosome 13 humain
Localisation génomique pour GTF3A
Localisation génomique pour GTF3A
Locus13q12.2Début27,424,619 bp[1]
Fin27,435,823 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 5 (souris)
Chr.Chromosome 5 (souris)[2]
Chromosome 5 (souris)
Localisation génomique pour GTF3A
Localisation génomique pour GTF3A
Locus5|5 G3Début146,885,467 bp[2]
Fin146,892,424 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • parotide

  • muscle glutéal

  • ventricule droit

  • gyrus temporal moyen

  • apex of heart

  • muscle biceps brachial

  • diaphragme

  • palpebral conjunctiva

  • body of tongue

  • Skeletal muscle tissue of biceps brachii
Fortement exprimé dans
  • otic placode

  • saccule

  • otic vesicle

  • paroi abdominale

  • embryon

  • tail of embryo

  • Épiblaste

  • ligne primitive

  • tube neural

  • corpuscule rénal
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
n/a
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • Fixation d'acide nucléique
  • liaison ADN
  • liaison ion métal
  • liaison ARN
  • 5S rRNA binding
  • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Composant cellulaire
  • noyau
  • nucléoplasme
Processus biologique
  • rRNA transcription
  • regulation of transcription, DNA-templated
  • transcription, DNA-templated
  • transcription by RNA polymerase III
  • ribosomal large subunit biogenesis
  • ribosome biogenesis
  • regulation of transcription by RNA polymerase II
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

2971

66596

Ensembl

ENSG00000122034

ENSMUSG00000016503

UniProt

Q92664

Q8VHT7

RefSeq (mRNA)

NM_002097

NM_025652

RefSeq (protéine)

NP_002088

NP_079928

Localisation (UCSC)Chr 13: 27.42 – 27.44 MbChr 5: 146.89 – 146.89 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
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GTF3A (pour facteur général de transcription 3A) ou Facteur de transcription IIIA, souvent abrégé TFIIIA est une protéine à doigts de zinc dont le gène GTF3A chez les humains est présent sur le chromosome 13. Cette protéine est impliquée dans la transcription du gène de l'ARN ribosomique 5S.

Historique

Le facteur de transcription IIIA est le premier facteur de transcription eucaryote à avoir été purifié de manière homogène et il a aussi été, en 1980 par Robert Roeder, le premier activateur spécifique de gène de mammifère identifié[5],[6]. Caractérisé ensuite par Wolffe et Brown en 1988, le gène du TFIIIA est aussi le premier facteur de transcription eucaryote dont le gène a été cloné[6],[7].

Le Facteur de transcription IIIA est aussi, chez le Xénope le premier facteur de transcription à doigt de zinc découvert[8].

Localisation

Comme déterminé initialement par la technique de FISH, le gène GTF3A est localisé chez l'humain, sur le bras q12 du chromosome 13[9],[10].

Structure

La protéine TFIIIA humaine contient neuf domaine en doigt de zinc avec motif Cys2His2[9].

Fonction

Le TFIIIA joue un rôle majeur dans la transcription du gène de l'ARNr 5S en se fixant sur la région de contrôle interne[7]. Non seulement, il se lie sur la région promotrice mais il est aussi capable de se fixer sur le transcrit de ce gène, l'ARNr 5S lui-même[7]. Cette protéine TFIIIA a donc la particularité inhabituelle d'être capable de se fixer à l'ADN mais aussi à l'ARN[7].

Références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000122034 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000016503 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. DR Engelke, SY Ng, BS Shastry et RG Roeder, « Specific interaction of a purified transcription factor with an internal control region of 5S RNA genes », Cell, vol. 19, no 3,‎ , p. 717–28 (PMID 6153931, DOI 10.1016/S0092-8674(80)80048-1, S2CID 23955175)
  6. a et b White 2013, p. 102.
  7. a b c et d Shastry 1996, p. 535.
  8. (en) M. Bruno, M Mahgoub et TS Macfarlan, « The Arms Race Between KRAB-Zinc Finger Proteins and Endogenous Retroelements and Its Impact on Mammals », Annual Review of Genetics, Annual Reviews, vol. 53, no 1,‎ , p. 393–416 (PMID 31518518, DOI 10.1146/annurev-genet-112618-043717, S2CID 202572327)
  9. a et b (en) H Arakawa, H Nagase, N Hayashi, M Ogawa, M Nagata, T Fujiwara, E Takahashi, S Shin et Y Nakamura, « Molecular cloning, characterization, and chromosomal mapping of a novel human gene (GTF3A) that is highly homologous to Xenopus transcription factor IIIA », Cytogenetics and Cell Genetics, vol. 70, nos 3–4,‎ , p. 235–8 (PMID 7789179, DOI 10.1159/000134041)
  10. (en) « Entrez Gene: GTF3A general transcription factor IIIA », sur Entrez Gene, (consulté le )

Bibliographie

  • (en) Barkur S. Shastry, « Transcription factor IIIA (TFIIIA) in the second decade », Journal of Cell Science, vol. 109, no 3,‎ , p. 535-539 (DOI 10.1242/jcs.109.3.535)
  • (en) Robert J. White, « TFIIIA », dans RNA Polymerase III Transcription, Springer Berlin Heidelberg, , 270 p. (ISBN 9783662035184), p. 102-109
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