Kromosom 16

Kromosom 16
Pasangan kromosom manusia 16 selepas proses penjaluran G.
Satu kromosom 16 dari ibu, dan satu lagi dari ayah.
Pasangan kromosom 16
pada kariogram lelaki manusia.
Ciri-ciri
Panjang (bp)96,330,374 bp
(CHM13)
Bilangan gen795 (CCDS)[1]
JenisAutosom
Kedudukan sentromerMetasentrik[2]
(36.8 Mbp[3])
Senarai gen lengkap
CCDSSenarai gen
HGNCSenarai gen
UniProtSenarai gen
NCBIGene list
Pemidang peta luaran
EnsemblKromosom 16
EntrezKromosom 16
NCBIKromosom 16
UCSCKromosom 16
Jujukan DNA penuh
RefSeqNC_000016 (FASTA)
GenBankCM000678 (FASTA)

Kromosom 16 ialah salah satu daripada 23 pasang kromosom yang ditemui pada manusia. Kebiasanya manusia mempunyai dua salinan kromosom ini. Kromosom 16 merangkumi kira-kira 96 juta pasangan asas (bahan binaan DNA) dan mewakili hanya di kurang daripada 3% daripada jumlah DNA dalam sel.

Gen

Bilangan gen

Berikut adalah beberapa anggaran kiraan gen kromosom manusia 16. Oleh kerana penyelidik menggunakan pendekatan yang berbeza untuk anotasi genom bagi menganggar bilangan gen pada setiap kromosom berbeza-beza (untuk butiran teknikal, lihat penganggaran gen). Di antara pelbagai projek, projek jujukan pengekodan konsensus kolaboratif (CCDS) mengambil strategi yang sangat konservatif. Jadi ramalan nombor gen CCDS mewakili had yang lebih rendah pada jumlah bilangan gen pengekodan protein manusia. [4]

Dianggarkan oleh Gen pengekodan protein Gen RNA tanpa pengekodan Pseudogen Sumber Tarikh keluaran
CCDS 795 — — [1] 08-09-2016
HGNC 802 251 365 [5] 2017-05-12
Ensembl 865 1,046 462 [6] 29-03-2017
UniProt 838 — — [7] 28-02-2018
NCBI 912 652 502 [8] [9] [10] 19-05-2017

Penyakit dan gangguan

Ciri-ciri yang berkaitan

  • Rambut merah

Jalur sitogenetik

Ideogram-ideogram penjaluran-G kromosom manusia 16
Ideogram penjaluran-G kromosom manusia 16 pada resolusi 850 bes per set haploid (bphs). Jarak jalur dalam rajah ini adalah berkadar terus terhadap jarak pasangan bes. Ideogram seperti ini digunakan secara umum di pelayar-pelayar genom (contohnya seperti Ensembl, Pelayar Genom UCSC).
Corak-corak penjaluran-G kromosom manusia 16 pada tiga resolusi yang berbeza (400,[13] 550[14] dan 850[3]). Jarak jalur dalam rajah ini berdasarkan ideogram dari ISCN (2013).[15] Ideogram berjenis ini mewakili jarak jalur relatif yang diperhati bawah mikroskop pada masa-masa yang berbeza sewaktu proses mitosis.[16]
Penjaluran-G kromosom manusia 16 pada resolusi 850 bphs
Kromosom Lengan Jalur Pemula ISCN[17] Hentian ISCN[17] Pemula pasangan bes Hentian pasangan bes Pewarnaan Ketumpatan
16 p 13.3 0 352 7000100000000000000♠1 7006780000000000000♠7800000 gneg
16 p 13.2 352 596 7006780000100000000♠7800001 7007104000000000000♠10400000 gpos 50
16 p 13.13 596 813 7007104000010000000♠10400001 7007125000000000000♠12500000 gneg
16 p 13.12 813 948 7007125000010000000♠12500001 7007147000000000000♠14700000 gpos 50
16 p 13.11 948 1070 7007147000010000000♠14700001 7007167000000000000♠16700000 gneg
16 p 12.3 1070 1246 7007167000010000000♠16700001 7007212000000000000♠21200000 gpos 50
16 p 12.2 1246 1409 7007212000010000000♠21200001 7007242000000000000♠24200000 gneg
16 p 12.1 1409 1558 7007242000010000000♠24200001 7007285000000000000♠28500000 gpos 50
16 p 11.2 1558 1856 7007285000010000000♠28500001 7007353000000000000♠35300000 gneg
16 p 11.1 1856 2045 7007353000010000000♠35300001 7007368000000000000♠36800000 acen
16 q 11.1 2045 2194 7007368000010000000♠36800001 7007384000000000000♠38400000 acen
16 q 11.2 2194 2709 7007384000010000000♠38400001 7007470000000000000♠47000000 gvar
16 q 12.1 2709 2953 7007470000010000000♠47000001 7007526000000000000♠52600000 gneg
16 q 12.2 2953 3142 7007526000010000000♠52600001 7007560000000000000♠56000000 gpos 50
16 q 13 3142 3346 7007560000010000000♠56000001 7007573000000000000♠57300000 gneg
16 q 21 3346 3657 7007573000010000000♠57300001 7007666000000000000♠66600000 gpos 100
16 q 22.1 3657 4023 7007666000010000000♠66600001 7007708000000000000♠70800000 gneg
16 q 22.2 4023 4118 7007708000010000000♠70800001 7007728000000000000♠72800000 gpos 50
16 q 22.3 4118 4294 7007728000010000000♠72800001 7007741000000000000♠74100000 gneg
16 q 23.1 4294 4551 7007741000010000000♠74100001 7007792000000000000♠79200000 gpos 75
16 q 23.2 4551 4659 7007792000010000000♠79200001 7007816000000000000♠81600000 gneg
16 q 23.3 4659 4768 7007816000010000000♠81600001 7007841000000000000♠84100000 gpos 50
16 q 24.1 4768 4930 7007841000010000000♠84100001 7007870000000000000♠87000000 gneg
16 q 24.2 4930 5025 7007870000010000000♠87000001 7007887000000000000♠88700000 gpos 25
16 q 24.3 5025 5120 7007887000010000000♠88700001 7007903383450000000♠90338345 gneg


Rujukan

  1. ^ a b "Search results - 16[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("has ccds"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2016-09-08. Dicapai pada 2017-05-28.
  2. ^ Tom Strachan; Andrew Read (2 April 2010). Human Molecular Genetics. Garland Science. m/s. 45. ISBN 978-1-136-84407-2.
  3. ^ a b Genome Decoration Page, NCBI. Ideogram data for Homo sapience (850 bphs, Assembly GRCh38.p3). Last update 2014-06-03. Retrieved 2017-04-26.
  4. ^ Pertea M, Salzberg SL (2010). "Between a chicken and a grape: estimating the number of human genes". Genome Biol. 11 (5): 206. doi:10.1186/gb-2010-11-5-206. PMC 2898077. PMID 20441615.
  5. ^ "Statistics & Downloads for chromosome 16". HUGO Gene Nomenclature Committee. 2017-05-12. Dicapai pada 2017-05-19.
  6. ^ "Chromosome 16: Chromosome summary - Homo sapiens". Ensembl Release 88. 2017-03-29. Dicapai pada 2017-05-19.
  7. ^ "Human chromosome 16: entries, gene names and cross-references to MIM". UniProt. 2018-02-28. Dicapai pada 2018-03-16.
  8. ^ "Search results - 16[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("genetype protein coding"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2017-05-19. Dicapai pada 2017-05-20.
  9. ^ "Search results - 16[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ( ("genetype miscrna"[Properties] OR "genetype ncrna"[Properties] OR "genetype rrna"[Properties] OR "genetype trna"[Properties] OR "genetype scrna"[Properties] OR "genetype snrna"[Properties] OR "genetype snorna"[Properties]) NOT "genetype protein coding"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2017-05-19. Dicapai pada 2017-05-20.
  10. ^ "Search results - 16[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("genetype pseudo"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2017-05-19. Dicapai pada 2017-05-20.
  11. ^ Maillard, A M (25 November 2014). "The 16p11.2 locus modulates brain structures common to autism, schizophrenia and obesity". Molecular Psychiatry. 20 (1): 140–147. doi:10.1038/mp.2014.145. PMC 4320286. PMID 25421402.
  12. ^ Richter, M (21 February 2018). "Altered TAOK2 activity causes autism-related neurodevelopmental and cognitive abnormalities through RhoA signaling". Molecular Psychiatry. 24 (9): 1329–1350. doi:10.1038/s41380-018-0025-5. PMC 6756231. PMID 29467497.
  13. ^ Genome Decoration Page, NCBI. Ideogram data for Homo sapience (400 bphs, Assembly GRCh38.p3). Last update 2014-03-04. Retrieved 2017-04-26.
  14. ^ Genome Decoration Page, NCBI. Ideogram data for Homo sapience (550 bphs, Assembly GRCh38.p3). Last update 2015-08-11. Retrieved 2017-04-26.
  15. ^ International Standing Committee on Human Cytogenetic Nomenclature (2013). ISCN 2013: An International System for Human Cytogenetic Nomenclature (2013). Karger Medical and Scientific Publishers. ISBN 978-3-318-02253-7.
  16. ^ Sethakulvichai, W.; Manitpornsut, S.; Wiboonrat, M.; Lilakiatsakun, W.; Assawamakin, A.; Tongsima, S. (2012). Estimation of band level resolutions of human chromosome images. In Computer Science and Software Engineering (JCSSE), 2012 International Joint Conference on. m/s. 276–282. doi:10.1109/JCSSE.2012.6261965. ISBN 978-1-4673-1921-8. S2CID 16666470.
  17. ^ a b Nilai ISCN adalah berdasarkan panjang jalur/ideograms daripada buku ISCN, An International System for Human Cytogenetic Nomenclature (2013). Nilai arbitrari.

Pautan luar

  • National Institutes of Health. "Chromosome 16". Genetics Home Reference. Diarkibkan daripada yang asal pada August 3, 2004. Dicapai pada 2017-05-06.
  • "Chromosome 16". Human Genome Project Information Archive 1990–2003. Dicapai pada 2017-05-06.
  • l
  • b
  • s
Genom manusia
Genom nukleus
Autosom
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7
  • 8
  • 9
  • 10
  • 11
  • 12
  • 13
  • 14
  • 15
  • 16
  • 17
  • 18
  • 19
  • 20
  • 21
  • 22
Kromosom seks
Genom mitokondrion
DNA mitokondrion manusia
Topik berkaitan