ABL1

ABL1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1AB2, 1AWO, 1BBZ, 1JU5, 1OPL, 1ZZP, 2ABL, 2E2B, 2FO0, 2G1T, 2G2F, 2G2H, 2G2I, 2GQG, 2HIW, 2HYY, 2HZ0, 2HZ4, 2HZI, 2V7A, 3CS9, 3EG0, 3EG1, 3EG2, 3EG3, 3EGU, 3K2M, 3QRI, 3QRJ, 3QRK, 3T04, 3UE4, 3UYO, 3PYY, 4J9B, 4J9C, 4J9D, 4J9E, 4J9F, 4J9G, 4J9H, 4J9I, 4JJB, 4JJC, 4JJD, 4TWP, 4WA9, 4XEY, 4YC8, 5DC9, 5DC4, 5DC0, 2O88, 5HU9

Ідентифікатори
Символи ABL1, ABL proto-oncogene 1, non-receptor tyrosine kinase, ABL, JTK7, bcr/abl, c-ABL, c-p150, v-abl, CHDSKM, BCR-ABL, Genes, abl
Зовнішні ІД OMIM: 189980 MGI: 87859 HomoloGene: 3783 GeneCards: ABL1
шифр КФ 2.7.10.2
Пов'язані генетичні захворювання
lymphoblastic leukemia, Філадельфійська хромосома[1]
Реагує на сполуку
bafetinib, бозутиніб, Дазатиніб, іматиніб, нілотиніб, ponatinib, saracatinib, іматиніб, ponatinib, saracatinib, rebastinib, umbralisib, imatinib mesylate[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

actin monomer binding
protein domain specific binding
SH3 domain binding
kinase activity
protein C-terminus binding
signaling receptor binding
ATP binding
protein kinase activity
nicotinate-nucleotide adenylyltransferase activity
non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity
зв'язування з іоном металу
proline-rich region binding
magnesium ion binding
transferase activity
actin filament binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
syntaxin binding
protein kinase C binding
DNA binding
nucleotide binding
manganese ion binding
mitogen-activated protein kinase binding
protein tyrosine kinase activity
four-way junction DNA binding
bubble DNA binding
phosphotyrosine residue binding
GO:0001105 transcription coactivator activity
neuropilin binding
SH2 domain binding
ephrin receptor binding
supercoiled DNA binding
sequence-specific double-stranded DNA binding

Клітинна компонента

цитоплазма
гіалоплазма
Ядерна мембрана
мембрана
extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane
мітохондрія
actin cytoskeleton
perinuclear region of cytoplasm
цитоскелет
клітинне ядро
ядерце
нуклеоплазма
cell leading edge
ядерні тільця
дендрит (нейробіологія)
GO:0009327 protein-containing complex
neuronal cell body
postsynapse

Біологічний процес

positive regulation of protein phosphorylation
B-1 B cell homeostasis
regulation of axon extension
neuromuscular process controlling balance
positive regulation of muscle cell differentiation
cellular response to DNA damage stimulus
protein phosphorylation
regulation of cell adhesion
regulation of microtubule polymerization
DNA damage induced protein phosphorylation
intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage
positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade
substrate adhesion-dependent cell spreading
platelet-derived growth factor receptor-beta signaling pathway
positive regulation of actin filament binding
B cell receptor signaling pathway
GO:0097285 апоптоз
negative regulation of endothelial cell apoptotic process
cerebellum morphogenesis
regulation of actin cytoskeleton reorganization
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
epidermal growth factor receptor signaling pathway
Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis
establishment of protein localization
thymus development
negative regulation of phospholipase C activity
positive regulation of mitotic cell cycle
actin filament branching
spleen development
GO:0001306 response to oxidative stress
Фагоцитоз
positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation
regulation of response to DNA damage stimulus
mitochondrial depolarization
positive regulation of Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway
platelet-derived growth factor receptor signaling pathway
regulation of endocytosis
activation of protein kinase C activity
regulation of actin cytoskeleton organization
фосфорилювання
signal transduction in response to DNA damage
GO:1900490 positive regulation of oxidoreductase activity
positive regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol
negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
regulation of cell motility
positive regulation of microtubule binding
адгезія клітин
regulation of autophagy
peptidyl-tyrosine autophosphorylation
alpha-beta T cell differentiation
regulation of cellular senescence
negative regulation of protein serine/threonine kinase activity
actin cytoskeleton organization
negative regulation of cellular senescence
positive regulation of osteoblast proliferation
GO:0007067 мітоз
activated T cell proliferation
ендоцитоз
negative regulation of cell-cell adhesion
B cell proliferation involved in immune response
cellular response to dopamine
positive regulation of cytosolic calcium ion concentration
positive regulation of neuron death
regulation of cell cycle
negative regulation of BMP signaling pathway
автофагія
B cell proliferation
negative regulation of ubiquitin-protein transferase activity
microspike assembly
positive regulation of apoptotic process
regulation of extracellular matrix organization
positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade
transitional one stage B cell differentiation
DNA mismatch repair
Bergmann glial cell differentiation
peptidyl-tyrosine phosphorylation
collateral sprouting
cellular response to lipopolysaccharide
negative regulation of mitotic cell cycle
cellular response to hydrogen peroxide
GO:0100026 Репарація ДНК
вроджений імунітет
neural tube closure
post-embryonic development
neuron differentiation
cellular response to oxidative stress
regulation of cell population proliferation
protein autophosphorylation
neuroepithelial cell differentiation
integrin-mediated signaling pathway
positive regulation of endothelial cell migration
диференціація клітин
regulation of Cdc42 protein signal transduction
neuropilin signaling pathway
endothelial cell migration
regulation of T cell differentiation
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
T cell receptor signaling pathway
positive regulation of stress fiber assembly
positive regulation of focal adhesion assembly
DNA conformation change
positive regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis
positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading
negative regulation of long-term synaptic potentiation
regulation of hematopoietic stem cell differentiation
regulation of modification of synaptic structure
positive regulation of blood vessel branching
positive regulation of actin cytoskeleton reorganization

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
25
11350
Ensembl
ENSG00000097007
ENSMUSG00000026842
UniProt
P00519
P00520
RefSeq (мРНК)
NM_007313
NM_005157
NM_001112703
NM_009594
NM_001283045
NM_001283046
NM_001283047
RefSeq (білок)
NP_005148
NP_009297
NP_001106174
NP_001269974
NP_001269975
NP_001269976
NP_033724
Локус (UCSC) Хр. 9: 130.71 – 130.89 Mb Хр. 2: 31.58 – 31.69 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ABL1 (англ. ABL proto-oncogene 1, non-receptor tyrosine kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 130 амінокислот, а молекулярна маса — 122 873[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MLEICLKLVGCKSKKGLSSSSSCYLEEALQRPVASDFEPQGLSEAARWNS
KENLLAGPSENDPNLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWC
EAQTKNGQGWVPSNYITPVNSLEKHSWYHGPVSRNAAEYLLSSGINGSFL
VRESESSPGQRSISLRYEGRVYHYRINTASDGKLYVSSESRFNTLAELVH
HHSTVADGLITTLHYPAPKRNKPTVYGVSPNYDKWEMERTDITMKHKLGG
GQYGEVYEGVWKKYSLTVAVKTLKEDTMEVEEFLKEAAVMKEIKHPNLVQ
LLGVCTREPPFYIITEFMTYGNLLDYLRECNRQEVNAVVLLYMATQISSA
MEYLEKKNFIHRDLAARNCLVGENHLVKVADFGLSRLMTGDTYTAHAGAK
FPIKWTAPESLAYNKFSIKSDVWAFGVLLWEIATYGMSPYPGIDLSQVYE
LLEKDYRMERPEGCPEKVYELMRACWQWNPSDRPSFAEIHQAFETMFQES
SISDEVEKELGKQGVRGAVSTLLQAPELPTKTRTSRRAAEHRDTTDVPEM
PHSKGQGESDPLDHEPAVSPLLPRKERGPPEGGLNEDERLLPKDKKTNLF
SALIKKKKKTAPTPPKRSSSFREMDGQPERRGAGEEEGRDISNGALAFTP
LDTADPAKSPKPSNGAGVPNGALRESGGSGFRSPHLWKKSSTLTSSRLAT
GEEEGGGSSSKRFLRSCSASCVPHGAKDTEWRSVTLPRDLQSTGRQFDSS
TFGGHKSEKPALPRKRAGENRSDQVTRGTVTPPPRLVKKNEEAADEVFKD
IMESSPGSSPPNLTPKPLRRQVTVAPASGLPHKEEAGKGSALGTPAAAEP
VTPTSKAGSGAPGGTSKGPAEESRVRRHKHSSESPGRDKGKLSRLKPAPP
PPPAASAGKAGGKPSQSPSQEAAGEAVLGAKTKATSLVDAVNSDAAKPSQ
PGEGLKKPVLPATPKPQSAKPSGTPISPAPVPSTLPSASSALAGDQPSST
AFIPLISTRVSLRKTRQPPERIASGAITKGVVLDSTEALCLAISRNSEQM
ASHSAVLEAGKNLYTFCVSYVDSIQQMRNKFAFREAINKLENNLRELQIC
PATAGSGPAATQDFSKLLSSVKEISDIVQR

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, клітинна адгезія, пошкодження ДНК, репарація ДНК, ендоцитоз, автофагія, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, ДНК, іоном магнію, іоном марганцю. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, мітохондрії.

Література

  • Shtivelman E., Lifshitz B., Gale R.P., Roe B.A., Canaani E. (1986). Alternative splicing of RNAs transcribed from the human abl gene and from the bcr-abl fused gene. Cell. 47: 277—284. PMID 3021337 DOI:10.1016/0092-8674(86)90450-2
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Groffen J., Heisterkamp N., Reynolds F.H. Jr., Stephenson J.R. (1983). Homology between phosphotyrosine acceptor site of human c-abl and viral oncogene products. Nature. 304: 167—169. PMID 6191223 DOI:10.1038/304167a0
  • Kipreos E.T., Wang J.Y. (1990). Differential phosphorylation of c-Abl in cell cycle determined by cdc2 kinase and phosphatase activity. Science. 248: 217—220. PMID 2183353 DOI:10.1126/science.2183353
  • Agami R., Blandino G., Oren M., Shaul Y. (1999). Interaction of c-Abl and p73alpha and their collaboration to induce apoptosis. Nature. 399: 809—813. PMID 10391250 DOI:10.1038/21697
  • Wang J.Y. (2000). Regulation of cell death by the Abl tyrosine kinase. Oncogene. 19: 5643—5650. PMID 11114745 DOI:10.1038/sj.onc.1203878

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з ABL1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з ABL1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:76 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
  6. UniProt, P00519 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 9
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»