CASP1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1BMQ, 1IBC, 1ICE, 1RWK, 1RWM, 1RWN, 1RWO, 1RWP, 1RWV, 1RWW, 1RWX, 1SC1, 1SC3, 1SC4, 2FQQ, 2H48, 2H4W, 2H4Y, 2H51, 2H54, 2HBQ, 2HBR, 2HBY, 2HBZ, 3D6F, 3D6H, 3D6M, 3E4C, 3NS7, 5FNA

Ідентифікатори

Символи

CASP1, ICE, IL1BC, P45, caspase 1

Зовнішні ІД

OMIM: 147678 MGI: 96544 HomoloGene: 133272 GeneCards: CASP1

шифр КФ

3.4.22.36

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cysteine-type peptidase activity • endopeptidase activity • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process • hydrolase activity • cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis • cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • kinase binding • cysteine-type endopeptidase activity • CARD domain binding • identical protein binding • cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway
Клітинна компонента	• NLRP3 inflammasome complex • цитоплазма • гіалоплазма • NLRP1 inflammasome complex • extracellular region • AIM2 inflammasome complex • мітохондрія • IPAF inflammasome complex • protease inhibitor complex • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• cellular response to organic substance • response to ATP • response to hypoxia • response to bacterium • membrane hyperpolarization • Піроптоз • protein processing • toxin transport • протеоліз • cellular response to mechanical stimulus • response to lipopolysaccharide • regulation of autophagy • interleukin-1 beta production • mitochondrial depolarization • programmed necrotic cell death • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0097285 апоптоз • regulation of apoptotic process • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • regulation of inflammatory response • execution phase of apoptosis • cellular response to lipopolysaccharide • cellular response to interferon-gamma • protein autoprocessing • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • positive regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • cytokine-mediated signaling pathway • cellular response to cytokine stimulus • apoptotic signaling pathway • positive regulation of interleukin-1 beta production
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


834


12362

Ensembl


ENSG00000137752


ENSMUSG00000025888

UniProt


P29466


P29452

RefSeq (мРНК)

NM_001223 NM_001257118 NM_001257119 NM_033292 NM_033293
NM_033294 NM_033295


NM_009807

RefSeq (білок)

NP_001214 NP_001244047 NP_001244048 NP_150634 NP_150635
NP_150636 NP_150637


NP_033937

Локус (UCSC)

Хр. 11: 105.03 – 105.04 Mb

Хр. 9: 5.3 – 5.31 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CASP1 (англ. Caspase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 404 амінокислот, а молекулярна маса — 45 159^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADKVLKEKR	KLFIRSMGEG	TINGLLDELL	QTRVLNKEEM	EKVKRENATV
MDKTRALIDS	VIPKGAQACQ	ICITYICEED	SYLAGTLGLS	ADQTSGNYLN
MQDSQGVLSS	FPAPQAVQDN	PAMPTSSGSE	GNVKLCSLEE	AQRIWKQKSA
EIYPIMDKSS	RTRLALIICN	EEFDSIPRRT	GAEVDITGMT	MLLQNLGYSV
DVKKNLTASD	MTTELEAFAH	RPEHKTSDST	FLVFMSHGIR	EGICGKKHSE
QVPDILQLNA	IFNMLNTKNC	PSLKDKPKVI	IIQACRGDSP	GVVWFKDSVG
VSGNLSLPTT	EEFEDDAIKK	AHIEKDFIAF	CSSTPDNVSW	RHPTMGSVFI
GRLIEHMQEY	ACSCDVEEIF	RKVRFSFEQP	DGRAQMPTTE	RVTLTRCFYL
FPGH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Alnemri E.S., Fernandes-Alnemri T., Litwack G. (1995). Cloning and expression of four novel isoforms of human interleukin-1 beta converting enzyme with different apoptotic activities. J. Biol. Chem. 270: 4312—4317. PMID 7876192 DOI:10.1074/jbc.270.9.4312
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Feng Q., Li P., Leung P.C.K., Auersperg N. (2004). Caspase-1 zeta, a new splice variant of caspase-1 gene. Genomics. 84: 587—591. PMID 15498465 DOI:10.1016/j.ygeno.2004.06.005
Humke E.W., Shriver S.K., Starovasnik M.A., Fairbrother W.J., Dixit V.M. (2000). ICEBERG: a novel inhibitor of interleukin-1beta generation. Cell. 103: 99—111. PMID 11051551 DOI:10.1016/S0092-8674(00)00108-2
Romanowski M.J., Scheer J.M., O'Brien T., McDowell R.S. (2004). Crystal structures of a ligand-free and malonate-bound human caspase-1: implications for the mechanism of substrate binding. Structure. 12: 1361—1371. PMID 15296730 DOI:10.1016/j.str.2004.05.010

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1499 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P29466 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.