EFNA1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3HEI, 3MBW, 3CZU

Ідентифікатори

Символи

EFNA1, B61, ECKLG, EFL1, EPLG1, LERK-1, LERK1, TNFAIP4, Ephrin A1, GMAN

Зовнішні ІД

OMIM: 191164 MGI: 103236 HomoloGene: 3262 GeneCards: EFNA1

Пов'язані генетичні захворювання

ожиріння^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signaling receptor binding • ephrin receptor binding
Клітинна компонента	• мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • anchored component of membrane • екзосома • внутрішньоклітинний • extracellular region • anchored component of plasma membrane
Біологічний процес	• regulation of cell adhesion mediated by integrin • ephrin receptor signaling pathway • aortic valve morphogenesis • cell-cell signaling • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of angiogenesis • mitral valve morphogenesis • endocardial cushion to mesenchymal transition involved in heart valve formation • regulation of blood vessel endothelial cell migration • regulation of axonogenesis • neuron differentiation • Хорда • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • substrate adhesion-dependent cell spreading • cell migration • negative regulation of epithelial to mesenchymal transition • negative regulation of dendritic spine morphogenesis • regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • negative regulation of thymocyte apoptotic process • MAPK cascade • Ангіогенез • axon guidance • positive regulation of protein phosphorylation • negative regulation of MAPK cascade • positive regulation of MAPK cascade • protein stabilization • positive regulation of protein tyrosine kinase activity • positive regulation of amyloid-beta formation • positive regulation of aspartic-type endopeptidase activity involved in amyloid precursor protein catabolic process • negative regulation of proteolysis involved in cellular protein catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1942


13636

Ensembl


ENSG00000169242


ENSMUSG00000027954

UniProt


P20827


P52793

RefSeq (мРНК)


NM_004428 NM_182685


NM_001162425 NM_010107

RefSeq (білок)


NP_004419 NP_872626


NP_001155897 NP_034237

Локус (UCSC)

Хр. 1: 155.13 – 155.13 Mb

Хр. 3: 89.18 – 89.19 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

EFNA1 (англ. Ephrin A1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 205 амінокислот, а молекулярна маса — 23 787^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEFLWAPLLG	LCCSLAAADR	HTVFWNSSNP	KFRNEDYTIH	VQLNDYVDII
CPHYEDHSVA	DAAMEQYILY	LVEHEEYQLC	QPQSKDQVRW	QCNRPSAKHG
PEKLSEKFQR	FTPFTLGKEF	KEGHSYYYIS	KPIHQHEDRC	LRLKVTVSGK
ITHSPQAHDN	PQEKRLAADD	PEVRVLHSIG	HSAAPRLFPL	AWTVLLLPLL
LLQTP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як ангіогенез, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Holzman L.B., Marks R.M., Dixit V.M. (1990). A novel immediate-early response gene of endothelium is induced by cytokines and encodes a secreted protein. Mol. Cell. Biol. 10: 5830—5838. PMID 2233719 DOI:10.1128/MCB.10.11.5830
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
Liu D.-P., Wang Y., Koeffler H.P., Xie D. (2007). Ephrin-A1 is a negative regulator in glioma through down-regulation of EphA2 and FAK. Int. J. Oncol. 30: 865—871. PMID 17332925

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з EFNA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3221 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P20827 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.