NUP153

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2EBQ, 2EBR, 2EBV, 2GQE, 4U0C, 4U0D

Ідентифікатори

Символи

NUP153, HN153, nucleoporin 153kDa, nucleoporin 153

Зовнішні ІД

OMIM: 603948 MGI: 2385621 HomoloGene: 68442 GeneCards: NUP153

Пов'язані генетичні захворювання

ожиріння^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • protein-membrane adaptor activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • nuclear localization sequence binding • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore
Клітинна компонента	• ядерна мембрана • nuclear periphery • мембрана • ядерна пора • нуклеоплазма • ядерце • nuclear inclusion body • nuclear pore nuclear basket • клітинне ядро • nuclear pore central transport channel • гіалоплазма • host cell
Біологічний процес	• mRNA transport • nuclear pore complex assembly • viral penetration into host nucleus • protein transport • viral entry into host cell • GO:0022415 viral process • negative regulation of RNA export from nucleus • mRNA export from nucleus • protein import into nucleus • regulation of glycolytic process • tRNA export from nucleus • protein sumoylation • viral transcription • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of cellular response to heat
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9972


218210

Ensembl


ENSG00000124789


ENSMUSG00000021374

UniProt


P49790


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_001278209 NM_001278210 NM_005124


NM_175749

RefSeq (білок)


NP_001265138 NP_001265139 NP_005115


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 6: 17.62 – 17.71 Mb

Хр. 13: 46.83 – 46.88 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NUP153 (англ. Nucleoporin 153) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 475 амінокислот, а молекулярна маса — 153 938^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASGAGGVGG	GGGGKIRTRR	CHQGPIKPYQ	QGRQQHQGIL	SRVTESVKNI
VPGWLQRYFN	KNEDVCSCST	DTSEVPRWPE	NKEDHLVYAD	EESSNITDGR
ITPEPAVSNT	EEPSTTSTAS	NYPDVLTRPS	LHRSHLNFSM	LESPALHCQP
STSSAFPIGS	SGFSLVKEIK	DSTSQHDDDN	ISTTSGFSSR	ASDKDITVSK
NTSLPPLWSP	EAERSHSLSQ	HTATSSKKPA	FNLSAFGTLS	PSLGNSSILK
TSQLGDSPFY	PGKTTYGGAA	AAVRQSKLRN	TPYQAPVRRQ	MKAKQLSAQS
YGVTSSTARR	ILQSLEKMSS	PLADAKRIPS	IVSSPLNSPL	DRSGIDITDF
QAKREKVDSQ	YPPVQRLMTP	KPVSIATNRS	VYFKPSLTPS	GEFRKTNQRI
DNKCSTGYEK	NMTPGQNREQ	RESGFSYPNF	SLPAANGLSS	GVGGGGGKMR
RERTRFVASK	PLEEEEMEVP	VLPKISLPIT	SSSLPTFNFS	SPEITTSSPS
PINSSQALTN	KVQMTSPSST	GSPMFKFSSP	IVKSTEANVL	PPSSIGFTFS
VPVAKTAELS	GSSSTLEPII	SSSAHHVTTV	NSTNCKKTPP	EDCEGPFRPA
EILKEGSVLD	ILKSPGFASP	KIDSVAAQPT	ATSPVVYTRP	AISSFSSSGI
GFGESLKAGS	SWQCDTCLLQ	NKVTDNKCIA	CQAAKLSPRD	TAKQTGIETP
NKSGKTTLSA	SGTGFGDKFK	PVIGTWDCDT	CLVQNKPEAI	KCVACETPKP
GTCVKRALTL	TVVSESAETM	TASSSSCTVT	TGTLGFGDKF	KRPIGSWECS
VCCVSNNAED	NKCVSCMSEK	PGSSVPASSS	STVPVSLPSG	GSLGLEKFKK
PEGSWDCELC	LVQNKADSTK	CLACESAKPG	TKSGFKGFDT	SSSSSNSAAS
SSFKFGVSSS	SSGPSQTLTS	TGNFKFGDQG	GFKIGVSSDS	GSINPMSEGF
KFSKPIGDFK	FGVSSESKPE	EVKKDSKNDN	FKFGLSSGLS	NPVSLTPFQF
GVSNLGQEEK	KEELPKSSSA	GFSFGTGVIN	STPAPANTIV	TSENKSSFNL
GTIETKSASV	APFTCKTSEA	KKEEMPATKG	GFSFGNVEPA	SLPSASVFVL
GRTEEKQQEP	VTSTSLVFGK	KADNEEPKCQ	PVFSFGNSEQ	TKDENSSKST
FSFSMTKPSE	KESEQPAKAT	FAFGAQTSTT	ADQGAAKPVF	SFLNNSSSSS
STPATSAGGG	IFGSSTSSSN	PPVATFVFGQ	SSNPVSSSAF	GNTAESSTSQ
SLLFSQDSKL	ATTSSTGTAV	TPFVFGPGAS	SNNTTTSGFG	FGATTTSSSA
GSSFVFGTGP	SAPSASPAFG	ANQTPTFGQS	QGASQPNPPG	FGSISSSTAL
FPTGSQPAPP	TFGTVSSSSQ	PPVFGQQPSQ	SAFGSGTTPN	SSSAFQFGSS
TTNFNFTNNS	PSGVFTFGAN	SSTPAASAQP	SGSGGFPFNQ	SPAAFTVGSN
GKNVFSSSGT	SFSGRKIKTA	VRRRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі, мембрані, комплексі ядерної пори.

Література

McMorrow I., Bastos R., Horton H., Burke B. (1994). Sequence analysis of a cDNA encoding a human nuclear pore complex protein, hnup153. Biochim. Biophys. Acta. 1217: 219—223. PMID 8110839 DOI:10.1016/0167-4781(94)90040-X
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Brownawell A.M., Macara I.G. (2002). Exportin-5, a novel karyopherin, mediates nuclear export of double-stranded RNA binding proteins. J. Cell Biol. 156: 53—64. PMID 11777942 DOI:10.1083/jcb.200110082
Frosst P., Guan T., Subauste C., Hahn K., Gerace L. (2002). Tpr is localized within the nuclear basket of the pore complex and has a role in nuclear protein export. J. Cell Biol. 156: 617—630. PMID 11839768 DOI:10.1083/jcb.200106046
Hase M.E., Cordes V.C. (2003). Direct interaction with nup153 mediates binding of Tpr to the periphery of the nuclear pore complex. Mol. Biol. Cell. 14: 1923—1940. PMID 12802065 DOI:10.1091/mbc.E02-09-0620
Krull S., Thyberg J., Bjorkroth B., Rackwitz H.R., Cordes V.C. (2004). Nucleoporins as components of the nuclear pore complex core structure and Tpr as the architectural element of the nuclear basket. Mol. Biol. Cell. 15: 4261—4277. PMID 15229283 DOI:10.1091/mbc.E04-03-0165

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з NUP153 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8062 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, P49790 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.