PTGDS

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4OS8, 2WWP, 3O19, 3O22, 3O2Y, 4IMN, 4IMO, 4ORR, 4ORS, 4ORU, 4ORW, 4ORX, 4ORY, 4OS0, 4OS3

Ідентифікатори

Символи

PTGDS, L-PGDS, LPGDS, PDS, PGD2, PGDS, PGDS2, prostaglandin D2 synthase

Зовнішні ІД

OMIM: 176803 MGI: 99261 HomoloGene: 737 GeneCards: PTGDS

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transporter activity • isomerase activity • fatty acid binding • prostaglandin-D synthase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • small molecule binding • retinoid binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • комплекс Ґольджі • rough endoplasmic reticulum • Ядерна мембрана • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • extracellular region • ендоплазматичний ретикулум • perinuclear region of cytoplasm • екзосома • клітинне ядро • міжклітинний простір
Біологічний процес	• prostaglandin metabolic process • lipid metabolism • cyclooxygenase pathway • fatty acid metabolic process • fatty acid biosynthetic process • prostaglandin biosynthetic process • regulation of circadian sleep/wake cycle, sleep • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5730


19215

Ensembl


ENSG00000107317


ENSMUSG00000015090

UniProt


P41222 Q5SQ11


O09114

RefSeq (мРНК)


NM_000954


NM_008963

RefSeq (білок)


NP_000945


NP_032989

Локус (UCSC)

Хр. 9: 136.98 – 136.98 Mb

Хр. 2: 25.36 – 25.36 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PTGDS (англ. Prostaglandin D2 synthase) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 190 амінокислот, а молекулярна маса — 21 029^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATHHTLWMG	LALLGVLGDL	QAAPEAQVSV	QPNFQQDKFL	GRWFSAGLAS
NSSWLREKKA	ALSMCKSVVA	PATDGGLNLT	STFLRKNQCE	TRTMLLQPAG
SLGSYSYRSP	HWGSTYSVSV	VETDYDQYAL	LYSQGSKGPG	EDFRMATLYS
RTQTPRAELK	EKFTAFCKAQ	GFTEDTIVFL	PQTDKCMTEQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до ізомераз. Задіяний у таких біологічних процесах як метаболізм жирних кислот, метаболізм ліпідів, транспорт, біосинтез жирних кислот, біосинтез ліпідів, біосинтез простагландинів, метаболізм простагландинів. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті Гольджі. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zahn M., Maeder M., Schmidt B., Bollensen E., Felgenhauer K. (1993). Purification and N-terminal sequence of beta-trace, a protein abundant in human cerebrospinal fluid. Neurosci. Lett. 154: 93—95. PMID 7689714 DOI:10.1016/0304-3940(93)90179-O
Giacomelli S., Leone M.-G., Grima J., Silvestrini B., Cheng C.Y. (1996). Astrocytes synthesize and secrete prostaglandin D synthetase in vitro. Biochim. Biophys. Acta. 1310: 269—276. PMID 8599604 DOI:10.1016/0167-4889(95)00182-4
White D.M., Takeda T., DeGroot L.J., Stefansson K., Arnason B.G.W. (1997). Beta-trace gene expression is regulated by a core promoter and a distal thyroid hormone response element. J. Biol. Chem. 272: 14387—14393. PMID 9162076 DOI:10.1074/jbc.272.22.14387
Halim A., Nilsson J., Ruetschi U., Hesse C., Larson G. (2011). Human urinary glycoproteomics; attachment site specific analysis of N-and O-linked glycosylations by CID and ECD. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 22171320 DOI:10.1074/mcp.M111.013649
Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins. J. Proteome Res. 12: 573—584. PMID 23234360 DOI:10.1021/pr300963h

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9592 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.
↑ UniProt, P41222 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.