TNFRSF11A

TNFRSF11A
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1LB5

Ідентифікатори
Символи TNFRSF11A, tumor necrosis factor receptor superfamily, member 11a, NFKB activator, CD265, FEO, LOH18CR1, ODFR, OFE, OPTB7, OSTS, PDB2, RANK, TRANCER, tumor necrosis factor receptor superfamily member 11a, TNF receptor superfamily member 11a, TRANCE-R
Зовнішні ІД OMIM: 603499 MGI: 1314891 HomoloGene: 2848 GeneCards: TNFRSF11A
Пов'язані генетичні захворювання
Polyostotic osteolytic dysplasia, hereditary expansile, autosomal recessive osteopetrosis 7[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

зв'язування з іоном металу
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
tumor necrosis factor-activated receptor activity
transmembrane signaling receptor activity
GO:0019974 cytokine binding
signaling receptor activity

Клітинна компонента

integral component of membrane
мембрана
integral component of plasma membrane
cell surface
external side of plasma membrane
гіалоплазма
клітинна мембрана

Біологічний процес

regulation of apoptotic process
response to cytokine
response to interleukin-1
адаптивна імунна відповідь
осифікація
monocyte chemotaxis
circadian temperature homeostasis
positive regulation of JUN kinase activity
osteoclast differentiation
cell-cell signaling
positive regulation of DNA-binding transcription factor activity
tumor necrosis factor-mediated signaling pathway
mammary gland alveolus development
multicellular organism development
response to tumor necrosis factor
response to lipopolysaccharide
positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
positive regulation of fever generation by positive regulation of prostaglandin secretion
positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade via TNFSF11-mediated signaling
positive regulation of cell population proliferation
apoptotic signaling pathway
response to radiation
TNFSF11-mediated signaling pathway
inflammatory response
lymph node development
GO:0072468 сигнальна трансдукція
positive regulation of bone resorption
multinuclear osteoclast differentiation

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
8792
21934
Ensembl
ENSG00000141655
ENSMUSG00000026321
UniProt
Q9Y6Q6
O35305
RefSeq (мРНК)
NM_001270949
NM_001270950
NM_001270951
NM_001278268
NM_003839
NM_009399
RefSeq (білок)
NP_001257878
NP_001257879
NP_001257880
NP_001265197
NP_003830
NP_033425
Локус (UCSC) Хр. 18: 62.33 – 62.39 Mb Хр. 1: 105.71 – 105.78 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TNFRSF11A (англ. TNF receptor superfamily member 11a) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 616 амінокислот, а молекулярна маса — 66 034[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAPRARRRRPLFALLLLCALLARLQVALQIAPPCTSEKHYEHLGRCCNKC
EPGKYMSSKCTTTSDSVCLPCGPDEYLDSWNEEDKCLLHKVCDTGKALVA
VVAGNSTTPRRCACTAGYHWSQDCECCRRNTECAPGLGAQHPLQLNKDTV
CKPCLAGYFSDAFSSTDKCRPWTNCTFLGKRVEHHGTEKSDAVCSSSLPA
RKPPNEPHVYLPGLIILLLFASVALVAAIIFGVCYRKKGKALTANLWHWI
NEACGRLSGDKESSGDSCVSTHTANFGQQGACEGVLLLTLEEKTFPEDMC
YPDQGGVCQGTCVGGGPYAQGEDARMLSLVSKTEIEEDSFRQMPTEDEYM
DRPSQPTDQLLFLTEPGSKSTPPFSEPLEVGENDSLSQCFTGTQSTVGSE
SCNCTEPLCRTDWTPMSSENYLQKEVDSGHCPHWAASPSPNWADVCTGCR
NPPGEDCEPLVGSPKRGPLPQCAYGMGLPPEEEASRTEARDQPEDGADGR
LPSSARAGAGSGSSPGGQSPASGNVTGNSNSTFISSGQVMNFKGDIIVVY
VSQTSQEGAAAAAEPMGRPVQEETLARRDSFAGNGPRFPDPCGGPEGLRE
PEKASRPVQEQGGAKA

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном натрію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

  • Sirinian C., Papanastasiou A.D., Zarkadis I.K., Kalofonos H.P. (2013). Alternative splicing generates a truncated isoform of human TNFRSF11A (RANK) with an altered capacity to activate NF-kappaB. Gene. 525: 124—129. PMID 23664977 DOI:10.1016/j.gene.2013.04.075

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з TNFRSF11A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11908 (англ.) . Архів оригіналу за 31 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
  5. UniProt, Q9Y6Q6 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 18
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350