ZFP42

ZFP42
Ідентифікатори
Символи ZFP42, REX1, ZNF754, REX-1, zfp-42, Rex1, ZFP42 zinc finger protein
Зовнішні ІД OMIM: 614572 MGI: 99187 HomoloGene: 7601 GeneCards: ZFP42
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
DNA binding
зв'язування з іоном металу
nucleic acid binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
sequence-specific DNA binding

Клітинна компонента

цитоплазма
клітинне ядро
transcription regulator complex
PcG protein complex

Біологічний процес

male gonad development
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
transcription, DNA-templated
female gonad development
GO:0007126 мейоз
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
132625
22702
Ensembl
ENSG00000179059
ENSMUSG00000051176
UniProt
Q96MM3
P22227
RefSeq (мРНК)
NM_001304358
NM_174900
NM_009556
RefSeq (білок)
NP_001291287
NP_777560
NP_033582
Локус (UCSC) Хр. 4: 188 – 188.01 Mb Хр. 8: 43.75 – 43.76 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ZFP42 (англ. ZFP42 zinc finger protein) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 310 амінокислот, а молекулярна маса — 34 802[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSQQLKKRAKTRHQKGLGGRAPSGAKPRQGKSSQDLQAEIEPVSAVWALC
DGYVCYEPGPQALGGDDFSDCYIECVIRGEFSQPILEEDSLFESLEYLKK
GSEQQLSQKVFEASSLECSLEYMKKGVKKELPQKIVGENSLEYSEYMTGK
KLPPGGIPGIDLSDPKQLAEFARKKPPINKEYDSLSAIACPQSGCTRKLR
NRAALRKHLLIHGPRDHVCAECGKAFVESSKLKRHFLVHTGEKPFRCTFE
GCGKRFSLDFNLRTHVRIHTGEKRFVCPFQGCNRRFIQSNNLKAHILTHA
NTNKNEQEGK

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Mongan N.P., Martin K.M., Gudas L.J. (2006). The putative human stem cell marker, Rex-1 (Zfp42): structural classification and expression in normal human epithelial and carcinoma cell cultures. Mol. Carcinog. 45: 887—900. PMID 16865673 DOI:10.1002/mc.20186

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30949 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
  4. UniProt, Q96MM3 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 4
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»