CSDE1

Cấu trúc được biết đến

PDB

Tìm trên Human UniProt: PDBe RCSB

Danh sách mã id PDB
1WFQ, 1X65, 2YTV, 2YTX, 2YTY

Mã định danh

Danh pháp

CSDE1, D1S155E, UNR, cold shock domain containing E1

ID ngoài

OMIM: 191510 HomoloGene: 5179 GeneCards: CSDE1

Bản thể gen
Chức năng phân tử	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding
Thành phần tế bào	• CRD-mediated mRNA stability complex • mitochondrial inner membrane • Màng tế bào • bộ máy Golgi • tế bào chất • cytosol
Quá trình sinh học	• male gonad development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, no-go decay
Nguồn: Amigo / QuickGO

Gen cùng nguồn

Loài

Người

Chuột

Entrez


7812


n/a

Ensembl


ENSG00000009307


n/a

UniProt


O75534


n/a

RefSeq (mRNA)

NM_007158 NM_001007553 NM_001130523 NM_001242891 NM_001242892
NM_001242893


n/a

RefSeq (protein)

NP_001007554 NP_001123995 NP_001229820 NP_001229821 NP_001229822
NP_009089


n/a

Vị trí gen (UCSC)

n/a

PubMed

^[1]

n/a

Wikidata

Xem/Sửa Người

Protein chứa domain chống choáng lạnh E1 (tiếng Anh: Cold shock domain-containing protein E1) là protein ở người được mã hóa bởi gen CSDE1.^[2]^[3]^[4]

Tham khảo

^ “Human PubMed Reference:”.
^ Jeffers M, Paciucci R, Pellicer A (tháng 10 năm 1990). “Characterization of unr; a gene closely linked to N-ras”. Nucleic Acids Res. 18 (16): 4891–9. PMC 331975. PMID 2204029.
^ Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (tháng 5 năm 1999). “Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro”. DNA Res. 5 (6): 355–64. doi:10.1093/dnares/5.6.355. PMID 10048485.
^ “Entrez Gene: CSDE1 cold shock domain containing E1, RNA-binding”.

Liên kết ngoài

Vị trí bộ gen CSDE1 ở người và thông tin chi tiết về gen CSDE1 có sẵn trên UCSC Genome Browser.

Đọc thêm

Nicolaiew N, Triqueneaux G, Dautry F (1991). “Organization of the human N-ras locus: characterization of a gene located immediately upstream of N-ras”. Oncogene. 6 (5): 721–30. PMID 2052355.
Boussadia O, Jacquemin-Sablon H, Dautry F (1993). “Exon skipping in the expression of the gene immediately upstream of N-ras (unr/NRU)”. Biochim. Biophys. Acta. 1172 (1–2): 64–72. doi:10.1016/0167-4781(93)90270-N. PMID 8439573.
Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, và đồng nghiệp (1996). “A "double adaptor" method for improved shotgun library construction”. Anal. Biochem. 236 (1): 107–13. doi:10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W, Andersson B, Worley KC, và đồng nghiệp (1997). “Large-Scale Concatenation cDNA Sequencing”. Genome Res. 7 (4): 353–8. doi:10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Hunt SL, Hsuan JJ, Totty N, Jackson RJ (1999). “unr, a cellular cytoplasmic RNA-binding protein with five cold-shock domains, is required for internal initiation of translation of human rhinovirus RNA”. Genes Dev. 13 (4): 437–48. doi:10.1101/gad.13.4.437. PMC 316477. PMID 10049359.
Grosset C, Chen CY, Xu N, và đồng nghiệp (2000). “A mechanism for translationally coupled mRNA turnover: interaction between the poly(A) tail and a c-fos RNA coding determinant via a protein complex”. Cell. 103 (1): 29–40. doi:10.1016/S0092-8674(00)00102-1. PMID 11051545.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). “DNA Cloning Using In Vitro Site-Specific Recombination”. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, và đồng nghiệp (2003). “Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Mitchell SA, Spriggs KA, Coldwell MJ, và đồng nghiệp (2003). “The Apaf-1 internal ribosome entry segment attains the correct structural conformation for function via interactions with PTB and unr”. Mol. Cell. 11 (3): 757–71. doi:10.1016/S1097-2765(03)00093-5. PMID 12667457.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, và đồng nghiệp (2004). “Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs”. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
Chang TC, Yamashita A, Chen CY, và đồng nghiệp (2004). “UNR, a new partner of poly(A)-binding protein, plays a key role in translationally coupled mRNA turnover mediated by the c-fos major coding-region determinant”. Genes Dev. 18 (16): 2010–23. doi:10.1101/gad.1219104. PMC 514181. PMID 15314026.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, và đồng nghiệp (2004). “The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)”. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiemann S, Arlt D, Huber W, và đồng nghiệp (2004). “From ORFeome to Biology: A Functional Genomics Pipeline”. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10.1101/gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Cornelis S, Tinton SA, Schepens B, và đồng nghiệp (2005). “UNR translation can be driven by an IRES element that is negatively regulated by polypyrimidine tract binding protein”. Nucleic Acids Res. 33 (10): 3095–108. doi:10.1093/nar/gki611. PMC 1142345. PMID 15928332.
Patel GP, Ma S, Bag J (2006). “The autoregulatory translational control element of poly(A)-binding protein mRNA forms a heteromeric ribonucleoprotein complex”. Nucleic Acids Res. 33 (22): 7074–89. doi:10.1093/nar/gki1014. PMC 1316114. PMID 16356927.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, và đồng nghiệp (2006). “The LIFEdb database in 2006”. Nucleic Acids Res. 34 (Database issue): D415–8. doi:10.1093/nar/gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Gregory SG, Barlow KF, McLay KE, và đồng nghiệp (2006). “The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1”. Nature. 441 (7091): 315–21. doi:10.1038/nature04727. PMID 16710414.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, và đồng nghiệp (2006). “Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks”. Cell. 127 (3): 635–48. doi:10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.

x t s Thư viện PDB
1wfq: Cấu trúc trong dung dịch của domain chống choáng lạnh thứ nhất của protein KIAA0885 (protein UNR) ở người 1x65: Cấu trúc trong dung dịch của domain chống choáng lạnh thứ ba của protein KIAA0885 (protein UNR) ở người