Dicer

DICER酶
已知的結構 PDB 直系同源搜索: PDBe RCSB PDBID列表 2EB1、​4NGB、​4NGC、​4NGD、​4NGF、​4NGG、​4NH3、​4NH5、​4NH6、​4NHA、​4WYQ
識別號
别名	DICER1；, DCR1, Dicer, Dicer1e, HERNA, MNG1, RMSE2, K12H4.8-LIKE, dicer 1, ribonuclease III, GLOW
外部ID	OMIM：606241 MGI：2177178 HomoloGene：13251 GeneCards：DICER1
相關疾病
胸膜肺母細胞瘤、​胚胎性横纹肌肉瘤、​DICER1 syndrome、​familial multinodular goiter[1]
基因位置（人类） 染色体 14號染色體[2] 基因座 14q32.13 起始 95,086,228 bp[2] 终止 95,158,010 bp[2]
基因位置（小鼠） 染色体 小鼠12号染色体[3] 基因座 12 E|12 54.83 cM 起始 104,654,001 bp[3] 终止 104,718,211 bp[3]
基因本體 分子功能 • 核苷酸結合 • helicase activity • protein domain specific binding • pre-miRNA binding • 金屬離子結合 • endoribonuclease activity • endoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters • 血浆蛋白结合 • siRNA binding • RNA binding • nuclease activity • double-stranded RNA binding • endonuclease activity • 水解酶活性 • ATP結合 • ribonuclease III activity • DNA结合 • deoxyribonuclease I activity 細胞組分 • 細胞質 • 细胞质基质 • RNA誘導沉默複合體 • 生长锥 • ARC complex • RISC-loading complex • 轴突 • 树突 • 细胞核 • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment • 外排體 生物學過程 • neuron projection morphogenesis • RNA processing • negative regulation of transcription by RNA polymerase II • peripheral nervous system myelin formation • pre-miRNA processing • positive regulation of myelination • nerve development • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • positive regulation of Schwann cell differentiation • negative regulation of Schwann cell proliferation • production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA • miRNA metabolic process • production of siRNA involved in RNA interference • 基因沉默 • apoptotic DNA fragmentation • 腫瘤壞死因子產生的負調控 • NIK/NF-kappaB signaling • negative regulation of gene expression • tube formation Sources:Amigo / QuickGO
直系同源
物種	人類	小鼠
Entrez	23405	192119
Ensembl	ENSG00000100697	ENSMUSG00000041415
UniProt	Q9UPY3	Q8R418,F8VQ54
mRNA​序列	​NM_001195573 ​NM_001271282 ​NM_001291628 ​NM_030621 ​NM_177438	NM_148948
蛋白序列	NP_001182502 ​NP_001258211 ​NP_001278557 ​NP_085124 ​NP_803187	NP_683750
基因位置​（UCSC）	Chr 14: 95.09 – 95.16 Mb	Chr 12: 104.65 – 104.72 Mb
PubMed​查找	[4]	[5]
維基數據
檢視/編輯人類 檢視/編輯小鼠

Dicer蛋白在人體內由DICER1基因編碼，是一種在RNA干擾中扮演着重要角色的RNA酶，屬於III型RNA酶。在RNA誘導沉默複合體（RISC）的激活中，Dicer扮演着核心角色。在RNA干擾過程中，Dicer可以將shRNA（小髮卡RNA）切割、加工爲siRNA（小干擾RNA），將miRNA前體加工爲miRNA（微RNA）。

功能

Dicer酶會將轉錄而成的、經Drosha酶初步處理的shRNA（小髮卡RNA）剪切爲siRNA，或將miRNA前體（pre-miRNA）剪切爲miRNA。隨後，siRNA或miRNA會激活RISC的組裝和功能的行使，使RNA干擾得以繼續進行^[6]。

結構

人DICER蛋白屬於III型RNA酶，具有解旋酶活性以及PAZ結構域（Piwi（英语：Piwi）/Argonaute/Zwille）^[8][9]。除了上述結構域外，DICER蛋白還有兩個RNaseIII結構域和兩個雙鏈RNA結合結構域（DUF283和dsRBD）^[10]。

目前的研究表明PAZ結構域可以和shRNA（小髮卡RNA）3'端兩個凸出的核苷酸結合，III型RNA酶結構域則會在dsRNA周圍形成一個假二聚體，啓動核酸鏈的剪切，使shRNA長度逐漸縮短。PAZ結構域和III型RNA酶結構域之間的距離由連接他們的螺旋結構決定，會影響到產生的miRNA/siRNA長度^[7]。Dicer的dsRBD結構域會與shRNA結合，不過目前並未解析出具體的結合位點。推測認爲dsRBD區可能會與一些調節蛋白（比如人體內的TRBP，果蠅體內的R2D2、Loqs）結合形成複合體，調控RNA酶活性，進而調節終產物的產生^[11]。有推測認爲解旋酶結構域會參與對長底物的處理^[11]

參見

• RNA干擾
• RNA誘導沉默複合體

參考