Alfa 1-antitripsin

edit
Inhibitor serpinske peptidaze, grupa A (alfa-1 antiproteinaza, antitripsin), član 1

Kristalna struktura serpina A1 (red) u inhibitornom kompleksu sa pankreatičkom elastazom (plavo). Prikaz je baziran na 2D26.
Dostupne strukture
1ATU, 1D5S, 1EZX, 1HP7, 1IZ2, 1KCT, 1OO8, 1OPH, 1PSI, 1QLP, 1QMB, 2D26, 2QUG, 3CWL, 3CWM, 3DRM, 3DRU, 3NDD, 3NDF, 3NE4, 3T1P, 7API, 8API, 9API
Identifikatori
SimboliSERPINA1; A1A; A1AT; AAT; PI; PI1; PRO2275; alpha1AT
Vanjski IDOMIM: 107400 MGI: 891971 HomoloGene: 20103 GeneCards: SERPINA1 Gene
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje proteaze
aktivnost inhibitora serinskog tipa endopeptidaze
proteinsko vezivanje
Celularna komponenta ekstracelularni region
proteinski ekstracelularni matriks
ekstracelularni prostor
Biološki proces respons na hipoksiju
degranulacija trombocita
respons akutne faze
Pregled RNK izražavanja
podaci
Ortolozi
VrstaČovekMiš
Entrez526520700
EnsemblENSG00000197249ENSMUSG00000066366
UniProtP01009P07758
RefSeq (mRNA)NM_000295NM_001252569
RefSeq (protein)NP_000286NP_001239498
Lokacija (UCSC)Chr 14:
94.84 - 94.86 Mb
Chr 12:
103.85 - 103.86 Mb
PubMed pretraga[1][2]

Alfa 1-antitripsin ili α1-antitripsin (A1AT) je proteazni inhibitor iz serpinske superfamilije. On je generalno poznat kao serumski tripsinski inhibitor. Alfa 1-antitripsin se takođe naziva alfa-1 proteinazni inhibitor (A1PI), jer inhibira širok opseg proteaza.[1] On štiti tkiva od enzima inflamatornih ćelija, posebno neutrofilne elastaze, i ima referentni opseg u krvi od 1,5 - 3,5 gram/litre, mada koncentracija može da bude znatno viša nakon akutne inflamacije.[2] U njegovom odsustvu, neutrofilna elastaza nesmetano razlaže elastin, koji doprinosi elastičnosti pluća, što stvara respiratorne probleme, kao što je emfisema.

Reference

  1. Gettins PG (2002). „Serpin structure, mechanism, and function”. Chem Rev 102 (12): 4751–804. DOI:10.1021/cr010170. PMID 12475206. 
  2. Kushner, Mackiewicz A (1993). The acute phase response: an overview.. CRC Press. str. 3–19. 

Literatura

  • Wu Y, Foreman RC (1991). „The molecular genetics of alpha 1 antitrypsin deficiency”. Bioessays 13 (4): 163–9. DOI:10.1002/bies.950130404. PMID 1859394. 
  • Kalsheker N (1989). „Alpha 1-antitrypsin: structure, function and molecular biology of the gene”. Biosci. Rep. 9 (2): 129–38. DOI:10.1007/BF01115992. PMID 2669992. 
  • Crystal RG (1990). „The alpha 1-antitrypsin gene and its deficiency states”. Trends Genet. 5 (12): 411–7. DOI:10.1016/0168-9525(89)90200-X. PMID 2696185. 
  • Carrell RW, Jeppsson JO, Laurell CB i dr.. (1982). „Structure and variation of human alpha 1-antitrypsin”. Nature 298 (5872): 329–34. DOI:10.1038/298329a0. PMID 7045697. 
  • Elliott PR, Abrahams JP, Lomas DA (1998). „Wild-type alpha 1-antitrypsin is in the canonical inhibitory conformation”. J. Mol. Biol. 275 (3): 419–25. DOI:10.1006/jmbi.1997.1458. PMID 9466920. 
  • Miyamoto Y, Akaike T, Maeda H (2000). „S-nitrosylated human alpha(1)-protease inhibitor”. Biochim. Biophys. Acta 1477 (1–2): 90–7. DOI:10.1016/S0167-4838(99)00264-2. PMID 10708851. 
  • Coakley RJ, Taggart C, O'Neill S, McElvaney NG (2001). „Alpha1-antitrypsin deficiency: biological answers to clinical questions”. Am. J. Med. Sci. 321 (1): 33–41. DOI:10.1097/00000441-200101000-00006. PMID 11202478. 
  • Lomas DA, Lourbakos A, Cumming SA, Belorgey D (2002). „Hypersensitive mousetraps, alpha1-antitrypsin deficiency and dementia”. Biochem. Soc. Trans. 30 (2): 89–92. DOI:10.1042/BST0300089. PMID 12023831. 
  • Kalsheker N, Morley S, Morgan K (2002). „Gene regulation of the serine proteinase inhibitors alpha1-antitrypsin and alpha1-antichymotrypsin”. Biochem. Soc. Trans. 30 (2): 93–8. DOI:10.1042/BST0300093. PMID 12023832. 
  • Perlmutter DH (2003). „Liver injury in α1-antitrypsin deficiency: an aggregated protein induces mitochondrial injury”. J. Clin. Invest. 110 (11): 1579–83. DOI:10.1172/JCI16787. PMC 151639. PMID 12464659. 
  • Lomas DA, Mahadeva R (2003). „α1-Antitrypsin polymerization and the serpinopathies: pathobiology and prospects for therapy”. J. Clin. Invest. 110 (11): 1585–90. DOI:10.1172/JCI16782. PMC 151637. PMID 12464660. 
  • Lisowska-Myjak B (2005). „AAT as a diagnostic tool”. Clin. Chim. Acta 352 (1–2): 1–13. DOI:10.1016/j.cccn.2004.03.012. PMID 15653097. 
  • Lomas DA (2005). „Molecular mousetraps, alpha1-antitrypsin deficiency and the serpinopathies”. Clinical medicine (London, England) 5 (3): 249–57. PMID 16011217. 
  • Rudnick DA, Perlmutter DH (2005). „Alpha-1-antitrypsin deficiency: a new paradigm for hepatocellular carcinoma in genetic liver disease”. Hepatology 42 (3): 514–21. DOI:10.1002/hep.20815. PMID 16044402. 
  • Mahr AD, Neogi T, Merkel PA (2006). „Epidemiology of Wegener's granulomatosis: Lessons from descriptive studies and analyses of genetic and environmental risk determinants”. Clin. Exp. Rheumatol. 24 (2 Suppl 41): S82–91. PMID 16859601. 
  • González-Sagrado M, López-Hernández S, Martín-Gil FJ, et al. (2000). "Alpha1-antitrypsin deficiencies masked by a clinical capillary electrophoresis system (CZE 2000)". Clinical Biochemistry, 33(1):79–80

Vanjske veze

Alfa 1-antitripsin na Wikimedijinoj ostavi
  • Alpha 1-antitrypsin
  • The MEROPS online database for peptidases and their inhibitors: I04.001 Arhivirano 2008-04-01 na Wayback Machine-u
  • Proteopedia: Alpha-1-antitrypsin
  • p
  • r
  • u
PDB Galerija
1atu: Nepresečen alfa-1-antitripsin
1atu: Nepresečen alfa-1-antitripsin  
1d5s: Kristalna struktura odsečenog antitrisinskog polimera
1d5s: Kristalna struktura odsečenog antitrisinskog polimera  
1ezx: Kristalna struktura kompleksa serpina:proteaza
1ezx: Kristalna struktura kompleksa serpina:proteaza  
1hp7: 2,1 A struktura nepresečenog alfa-1-antitripsina prikazuje varijabilnost reaktivnosg centra i drugih petlji
1hp7: 2,1 A struktura nepresečenog alfa-1-antitripsina prikazuje varijabilnost reaktivnosg centra i drugih petlji  
1iz2: Interakcije uzrokuju kinetičku klopku u savijanju serpinskog proteina
1iz2: Interakcije uzrokuju kinetičku klopku u savijanju serpinskog proteina  
1kct: Alfa1-antitripsin
1kct: Alfa1-antitripsin  
1oo8: Kristalna struktura A1PI-Pittsburg u prirodnoj konformaciji
1oo8: Kristalna struktura A1PI-Pittsburg u prirodnoj konformaciji  
1oph: Nekovalentni kompleks između alfa-1-pi-Pittsburgh i S195A tripsina
1oph: Nekovalentni kompleks između alfa-1-pi-Pittsburgh i S195A tripsina  
1psi: Nepromenjeni rekombinovani alfa1-antitripsin mutant Phe 51 do Leu
1psi: Nepromenjeni rekombinovani alfa1-antitripsin mutant Phe 51 do Leu  
1qlp: 2,0 A struktura nepromenjenog alfa-1-antitripsina: kanonički šablon za aktivne serpine
1qlp: 2,0 A struktura nepromenjenog alfa-1-antitripsina: kanonički šablon za aktivne serpine  
1qmb: Odsečeni alfa-1-antitripsin polimer
1qmb: Odsečeni alfa-1-antitripsin polimer  
2d26: Distorzija aktivnog mesta je dovoljna za inhibiciju proteaze druge kristalne strukture kovalentnog komleksa serpin-proteinaza
2d26: Distorzija aktivnog mesta je dovoljna za inhibiciju proteaze druge kristalne strukture kovalentnog komleksa serpin-proteinaza  
7api: S varijanta ljudskog alfa1-antitripsina. Struktura i implikacije za funkciju i metabolizam
7api: S varijanta ljudskog alfa1-antitripsina. Struktura i implikacije za funkciju i metabolizam  
8api: S varijanta ljudskog alfa1-antitripsina. Struktura i implikacije za funkciju i metabolizam
8api: S varijanta ljudskog alfa1-antitripsina. Struktura i implikacije za funkciju i metabolizam  
9api: S varijanta ljudskog alfa1-antitripsina. Struktura i implikacije za funkciju i metabolizam
9api: S varijanta ljudskog alfa1-antitripsina. Struktura i implikacije za funkciju i metabolizam  
  • p
  • r
  • u
Serum
serpini: alfa-1 (Alfa 1-antihimotripsin, Alfa 1-antitripsin)  alfa-2 (Alfa 2-antiplasmin)  Antitrombin (Heparin kofactor II)

noseći proteini: alfa-1 (Transkortin)  alfa-2 (Ceruloplasmin Retinol vezujući protein

drugi: alfa-1 (Orosomukoid)  alfa-2 (alfa-2-Makroglobulin, Haptoglobin)
noseći proteini: Seks hormon-vezujući globulin  Transferin
drugi: Angiostatin  Hemopeksin  Beta-2 mikroglobulin  Factor H  Plazminogen  Properdin
Drugi
Fibronektin  Makroglobulin/Mikroglobulin  Transkobalamin
Drugi
Beta-laktoglobulini (Laktoferin)  Tiroglobulin  Alfa-laktalbumin
Albumini
Konalbumin  Ovalbumin  Avidin
Ljudski serumski albumin  Goveđi serumski albumin  Prealbumin
Drugi
C reaktivni protein  Laktalbumin (Alfa-laktalbumin)  Parvalbumin  Ricin