Fibronektin

edit
Fibronectin 1

PDB grafika bazirano na 1e88.
Dostupne strukture
1e88, 1e8b, 1fbr, 1fna, 1fnf, 1fnh, 1j8k, 1o9a, 1oww, 1q38, 1qgb, 1qo6, 1ttf, 1ttg, 2cg6, 2cg7, 2cku, 2fn2, 2fnb, 2gee, 2h41, 2h45, 2ha1
Identifikatori
SimboliFN1; CIG; DKFZp686F10164; DKFZp686H0342; DKFZp686I1370; DKFZp686O13149; FINC; FN; LETS; MSF
Vanjski IDOMIM: 135600 MGI: 95566 HomoloGene: 1533 GeneCards: FN1 Gene
Ontologija gena
Molekularna funkcija strukturni konstituent ekstracelularnog matriksa
vezivanje kolagena
vezivanje heparina
aktivnost oksidoreduktaze
Celularna komponenta ekstracelularni region
proteinski ekstracelularni matriks
ER-Goldžijev intermedijarni kompartman
Biološki proces respons akutne-faze
ćelijska adhezija
transmembranki receptor proteinska tirozin kinaza, signalni put
metabolički proces
respons na ranjavanje
ćelijska migracija
Pregled RNK izražavanja
podaci
Ortolozi
VrstaČovekMiš
Entrez233514268
EnsemblENSG00000115414ENSMUSG00000026193
UniProtP02751Q3UZF9
RefSeq (mRNA)NM_002026NM_010233
RefSeq (protein)NP_002017NP_034363
Lokacija (UCSC)Chr 2:
215.93 - 216.01 Mb
Chr 1:
71.52 - 71.59 Mb
PubMed pretraga[1][2]

Fibronektin je glikoprotein ekstracelularnog matriksa visoke molekulske težine koji se vezuje za proteinske receptore integrine koji premoštavaju membrane.[1] Pored integrina, fibronektin se isto vezuje za komponente ekstracelularnog matriksa kao što su kolagen[2], fibrin i heparan sulfat proteoglukani (e.g. sindekani). Fibronektin protein je kodiran jednim genom, ali alternativno splajsovanje njegove pre-iRNK dovodi do kreiranja nekoliko proteinskih izoformi.

Dve vrste fibronektina su prisutne u kičmenjacima:[1]

Fibronektin igra važnu ulogu u ćelijskoj adheziji, migraciji, i diferencijaciji. On je važan u procesima zarastanja rana i embrionskog razvića.[1] Nepravilno ekspresija, degeneracija, i organizacija fibronektin gena su bili povezani sa brojnim patološkim okolnostima, uključujući rak i fibrozu.[3]

Struktura

Fibronektin postoji kao dimer, koji se sastoji od dva skoro identična monomera povezanih parom disulfidnih veza.[1][4] Svaki fibronektinski monomer ima molekulsku težinu od 230-250 kDa, i sadrži tri tipa proteinskih modula: tip I, II, i III. Sva tri modula se sastoje of dve antiparalelne β-ploče; međutim, tip I i tip II su stabilizovani intra-lančanim disulfidnim mostovima, dok tip III modul ne sadrži disulfidne mostove. Odsustvo disulfidnih intra-lanaca u tipu III modulima dozvoljava im da se delimično razviju pod uticajem sile.[5]

Tri regiona promenljivog RNK sjedinjavanja se javljaju duž fibronektin monomera.[4] Jedan ili oba "ekstra" tipa III modula (EIIIA i EIIIB) mogu biti prisutna u ćelijskom fibronektinu, ali oni nisu nikad prisutni u fibronektinu iz krvne plazme. Promenljivi V-region postoji između III14-15 (14tog i 15tog tipa III modula). V-region strukture je različit of tipa I, II, i III modula, a njegovo prisustvo i dužina mogu varirati. V-region sadrži vezujuće mesto za α4β1 integrine. Ono je prisutno u većini ćelijskih fibronektina, ali samo jedna of dve pod-jedinice fibronektin dimera plazme sadrži V-region sekvencu.

Moduli su aranžirani u nekoliko funkcionalnih i protein-vezujućih domena duž fibronektin monomera. Postoje četiri fibronektin-vezujuća domena, što dozvoljava fibronektinu da se asocira sa drugim fibronektin molekulima.[4] Jedan of tih fibronektin-vezujućih domena, I1-5, se naziva "saborni domen", i on je neophodan za inicijaciju fibronektin matriks konstrukcije. Moduli III9-10 su "ćelijski vezujući domeni" fibronektina. RGD sekvenca (Arg-Gly-Asp) je locirana III10 i one je mesto ćelijskog pripajanja putem αVβ1 i αVβ3 integrina na ćelijskoj površini. "Mesto sjedinjavanja" je na III9 i ima ulogu u modulaciji fibronektinove asocijacije sa αVβ1 integrinima.[6] Fibronektin isto sadrži domene za fibrin-vezivanje (I1-5, I10-12), kolagen-vezivanje (I6-9), fibulin-1-vezivanje (III13-14), i sindekan-vezivanje (III12-14).[4]

Modularna struktura fibronektina i njegovih vezujućih domena

Funkcija

Fibronektin ima brojne funkcije koje osiguravaju normalno funkcionisanje kičmenjačkih organizama.[1] On je posreduje ćelijsku adheziju, rast, migraciju i diferencijaciju. Ćelijski fibronektin je konstruisan u ekstra-ćelijskom matriksu, jednoj nerastvornoj mreži koja odvaja i podržava organe i tkiva organizma.

Fibronektin igra presudnu ulogu u lečenju rana. [7] Zajedno sa fibrinom, plazma fibronektin se deponuje na mestu povrede, formirajući krvnu grudvu koja zaustavlja krvarenje i zaštićuje potporno tkivo. Dok se popravka tkiva nastavlja, fibroblasti i makrofage počinju da preuređuju površinu, degradirajući proteine koji formiraju privremeni matriks krvne grudve i zamenjujući ih sa matriksom koji više podseća normalnom okružujećem tkivu. Fibroblasti izlučuju proteaze, uključujući matriks metaloproteaze, koje svaruju fibronektin is plazme, i potom fibroblasti izlučuju ćelijski fibronektin i sklapaju ga u nerastvorni matriks. Fragmentacija fibronektina proteazama je bila predložena da promoviše kontrakciju rane, što je kritičan korak u zarastanju rane. Fragmentacija fibronektina isto tako izlaže njegov V-region, koji sadrži mesto za vezivanje α4β1 integrina. Ti fragmenti fibronektina se veruje da uvećavaju vezivanje ćelija koje izražavaju α4β1 integrin, što im dozvoljava da se priljube i kontraktuju okružujući matriks.

Fibronektin je neophodan za embriogenezu, i inaktiviranje gena fibronektina uzrokuje ranu embrionsku letalnost. [8] Fibronektin je važan u upravljanju ćelijskom adhezijom i migracijom u toku embrionskog razvoja. U razvoju sisara, odsustvo fibronektina dovodi do defekata mezoderma, i nervne cevi, i vaskularnog razvoja.

Fibronektin se isto nalazi u normalnoj ljudskog pljuvački, što pomaže sprečavanju kolonizacije usne šupljine i grla potencijalno patogenim bakterijama.[9]

Matriks konstrukcija

Ćelijski fibronektin formira nerastvorni fibrilarni matriks u kompleksnom ćelijski-posedovanom procesu.[10] Formiranje fibronektin matriksa počinje kad se rastvorljivi, kompaktni fibronektin dimeri izluče is ćelija, obično fibroblasta. Ti rastvorljivi dimeri se vežu za α5β1 integrin receptore na ćelijskoj površini i pomažu u grupisanju integrina. Lokalna koncentracija integrin-vezanog fibronektina se povećava, dozvoljavajući vezanim fibronektin molekulima da lakše uzajamno deluju. U daljem progresu formiranja fibronektina, rastvorljivi filamenti se pretvaraju u veće nerastvorne filamente koji sačinjavaju ekstraćelijski matriks.

Promena fibronektina od rastvorne u nerastvorne filamente se odvija kad su prikrivena fibronektin-vezujuća mesta izložena duž vezanih fibronektin molekula. Veruje se da ćelije rastežu fibronektin povlačenjem njihovih fibronektin-vezanih integrin receptorima. Ta sila delimično razvija fibronektin ligand, otkrivajući skrivena fibronektin-vezujuća mesta i dozvoljavajući obližnjim fibronektin molekulima da se vežu. Ta fibronektin-fibronektin interakcija omogućava rastvorljivom, ćelijski-asociranim filamentima da se granaju i stabilizuju u nerastvorni fibronektin matriks.

Uloga u raku

Nekoliko morfoloških promena primećenih u tumorima i tumor-izvedenim ćelijskim linijama je pripisano smanjenoj fibronektin ekspresiji, povećanoj fibronektin degradaciji, i smanjenoj ekspresiji fibronektin-vezujućeg receptora, kao što su α5β1 integrini.[11] Fibronektin je impliciran u razvoju karcinoma.[12] U karcinomu plućima, fibronektin ekspresija je povećana, posebno u plućnom karcinomu ne-malih ćelija.

Interakcije

Pokazano je da fibronektin stupa u interakcije sa kolagenom, tip VII, alfa 1,[13][14] TRIB3,[15] lipoproteinom (a),[16] Tenascin C,[17] CD44[18] i IGFBP3.[19][20]

Vidi još

  • Fetalni fibronektin
  • Fibronektin tip II domain
  • Fibronektin tip III domain

Reference

  1. 1,0 1,1 1,2 1,3 1,4 Pankov R, Yamada KM (October 2002). „Fibronectin at a glance”. Journal of cell science 115 (Pt 20): 3861–3. DOI:10.1242/jcs.00059. PMID 12244123. 
  2. Donald Voet, Judith G. Voet (2005). Biochemistry (3 izd.). Wiley. str. 233-240. ISBN 978-0-471-19350-0. 
  3. Williams CM, Engler AJ, Slone RD, Galante LL, Schwarzbauer JE (May 2008). „Fibronectin expression modulates mammary epithelial cell proliferation during acinar differentiation”. Cancer research 68 (9): 3185–92. DOI:10.1158/0008-5472.CAN-07-2673. PMC 2748963. PMID 18451144. 
  4. 4,0 4,1 4,2 4,3 Mao Y, Schwarzbauer JE (September 2005). „Fibronectin fibrillogenesis, a cell-mediated matrix assembly process”. Matrix biology : journal of the International Society for Matrix Biology 24 (6): 389–99. DOI:10.1016/j.matbio.2005.06.008. PMID 16061370. 
  5. Erickson HP (2002). „Stretching fibronectin”. Journal of muscle research and cell motility 23 (5-6): 575–80. DOI:10.1023/A:1023427026818. PMID 12785106. 
  6. Sechler JL, Corbett SA, Schwarzbauer JE (December 1997). „Modulatory roles for integrin activation and the synergy site of fibronectin during matrix assembly”. Molecular biology of the cell 8 (12): 2563–73. PMC 25728. PMID 9398676. 
  7. Valenick LV, Hsia HC, Schwarzbauer JE (September 2005). „Fibronectin fragmentation promotes alpha4beta1 integrin-mediated contraction of a fibrin-fibronectin provisional matrix”. Experimental cell research 309 (1): 48–55. DOI:10.1016/j.yexcr.2005.05.024. PMID 15992798. 
  8. George EL, Georges-Labouesse EN, Patel-King RS, Rayburn H, Hynes RO (December 1993). „Defects in mesoderm, neural tube and vascular development in mouse embryos lacking fibronectin”. Development (Cambridge, England) 119 (4): 1079–91. PMID 8306876. 
  9. Hasty DL, Simpson WA (September 1987). „Effects of fibronectin and other salivary macromolecules on the adherence of Escherichia coli to buccal epithelial cells”. Infection and immunity 55 (9): 2103–9. PMC 260663. PMID 3305363. Arhivirano iz originala na datum 2009-03-08. Pristupljeno 2014-05-20. 
  10. Wierzbicka-Patynowski I, Schwarzbauer JE (August 2003). „The ins and outs of fibronectin matrix assembly”. Journal of cell science 116 (Pt 16): 3269–76. DOI:10.1242/jcs.00670. PMID 12857786. 
  11. Hynes, Richard O. (1990). Fibronectins. Berlin: Springer-Verlag. ISBN 0-387-97050-9. 
  12. Han S, Khuri FR, Roman J (January 2006). „Fibronectin stimulates non-small cell lung carcinoma cell growth through activation of Akt/mammalian target of rapamycin/S6 kinase and inactivation of LKB1/AMP-activated protein kinase signal pathways”. Cancer research 66 (1): 315–23. DOI:10.1158/0008-5472.CAN-05-2367. PMID 16397245. 
  13. Lapiere, J C; Chen J D, Iwasaki T, Hu L, Uitto J, Woodley D T (November 1994). „Type VII collagen specifically binds fibronectin via a unique subdomain within the collagenous triple helix”. J. Invest. Dermatol. (UNITED STATES) 103 (5): 637–41. DOI:10.1111/1523-1747.ep12398270. ISSN 0022-202X. PMID 7963647. 
  14. Chen, M; Marinkovich M P, Veis A, Cai X, Rao C N, O'Toole E A, Woodley D T (June 1997). „Interactions of the amino-terminal noncollagenous (NC1) domain of type VII collagen with extracellular matrix components. A potential role in epidermal-dermal adherence in human skin”. J. Biol. Chem. (UNITED STATES) 272 (23): 14516–22. DOI:10.1074/jbc.272.23.14516. ISSN 0021-9258. PMID 9169408. 
  15. Zhou, Ying; Li Lu, Liu Qiongming, Xing Guichun, Kuai Xuezhang, Sun Jing, Yin Xiushan, Wang Jian, Zhang Lingqiang, He Fuchu (May 2008). „E3 ubiquitin ligase SIAH1 mediates ubiquitination and degradation of TRB3”. Cell. Signal. (England) 20 (5): 942–8. DOI:10.1016/j.cellsig.2008.01.010. ISSN 0898-6568. PMID 18276110. 
  16. Salonen, E M; Jauhiainen M, Zardi L, Vaheri A, Ehnholm C (December 1989). „Lipoprotein(a) binds to fibronectin and has serine proteinase activity capable of cleaving it”. EMBO J. (ENGLAND) 8 (13): 4035–40. ISSN 0261-4189. PMC 401578. PMID 2531657. 
  17. Chung, C Y; Zardi L, Erickson H P (December 1995). „Binding of tenascin-C to soluble fibronectin and matrix fibrils”. J. Biol. Chem. (UNITED STATES) 270 (48): 29012–7. DOI:10.1074/jbc.270.48.29012. ISSN 0021-9258. PMID 7499434. 
  18. Jalkanen, S; Jalkanen M (February 1992). „Lymphocyte CD44 binds the COOH-terminal heparin-binding domain of fibronectin”. J. Cell Biol. (UNITED STATES) 116 (3): 817–25. DOI:10.1083/jcb.116.3.817. ISSN 0021-9525. PMC 2289325. PMID 1730778. 
  19. Martin, J A; Miller B A, Scherb M B, Lembke L A, Buckwalter J A (July 2002). „Co-localization of insulin-like growth factor binding protein 3 and fibronectin in human articular cartilage”. Osteoarthr. Cartil. (England) 10 (7): 556–63. DOI:10.1053/joca.2002.0791. ISSN 1063-4584. PMID 12127836. 
  20. Gui, Y; Murphy L J (May 2001). „Insulin-like growth factor (IGF)-binding protein-3 (IGFBP-3) binds to fibronectin (FN): demonstration of IGF-I/IGFBP-3/fn ternary complexes in human plasma”. J. Clin. Endocrinol. Metab. (United States) 86 (5): 2104–10. DOI:10.1210/jc.86.5.2104. ISSN 0021-972X. PMID 11344214. 

Literatura

  • ffrench-Constant C (1996). „Alternative splicing of fibronectin--many different proteins but few different functions.”. Exp. Cell Res. 221 (2): 261–71. DOI:10.1006/excr.1995.1374. PMID 7493623. 
  • Snásel J, Pichová I (1997). „The cleavage of host cell proteins by HIV-1 protease.”. Folia Biol. (Praha) 42 (5): 227–30. DOI:10.1007/BF02818986. PMID 8997639. 
  • Schor SL, Schor AM (2003). „Phenotypic and genetic alterations in mammary stroma: implications for tumour progression.”. Breast Cancer Res. 3 (6): 373–9. DOI:10.1186/bcr325. PMC 138703. PMID 11737888. 
  • Przybysz M, Katnik-Prastowska I (2002). „[Multifunction of fibronectin]” [Multifunction of fibronectin] (Polish). Postȩpy higieny i medycyny doświadczalnej 55 (5): 699–713. PMID 11795204. 
  • Rameshwar P, Oh HS, Yook C, et al. (2003). „Substance p-fibronectin-cytokine interactions in myeloproliferative disorders with bone marrow fibrosis.”. Acta Haematol. 109 (1): 1–10. DOI:10.1159/000067268. PMID 12486316. 
  • Cho J, Mosher DF (2006). „Role of fibronectin assembly in platelet thrombus formation.”. J. Thromb. Haemost. 4 (7): 1461–9. DOI:10.1111/j.1538-7836.2006.01943.x. PMID 16839338. 
  • Schmidt DR, Kao WJ (2007). „The interrelated role of fibronectin and interleukin-1 in biomaterial-modulated macrophage function.”. Biomaterials 28 (3): 371–82. DOI:10.1016/j.biomaterials.2006.08.041. PMID 16978691. 
  • Dallas SL, Chen Q, Sivakumar P (2006). „Dynamics of assembly and reorganization of extracellular matrix proteins.”. Curr. Top. Dev. Biol. 75: 1–24. DOI:10.1016/S0070-2153(06)75001-3. PMID 16984808. 
  • Hynes, Richard O. (1990). Fibronectins. Berlin: Springer-Verlag. 

Vanjske veze

  • Vikimedija ostava ima još multimedijalnih fajlova vezanih za: Fibronektin
  • [3]
  • Fibronektin protein
  • MeSH Fibronectin
  • Molekulske interakcije fibronektina Arhivirano 2010-11-28 na Wayback Machine-u
  • p
  • r
  • u
Serum
serpini: alfa-1 (Alfa 1-antihimotripsin, Alfa 1-antitripsin alfa-2 (Alfa 2-antiplasmin)  Antitrombin (Heparin kofactor II)

noseći proteini: alfa-1 (Transkortin)  alfa-2 (Ceruloplasmin Retinol vezujući protein

drugi: alfa-1 (Orosomukoid)  alfa-2 (alfa-2-Makroglobulin, Haptoglobin)
noseći proteini: Seks hormon-vezujući globulin  Transferin
drugi: Angiostatin  Hemopeksin  Beta-2 mikroglobulin  Factor H  Plazminogen  Properdin
Drugi
Fibronektin  Makroglobulin/Mikroglobulin  Transkobalamin
Drugi
Beta-laktoglobulini (Laktoferin)  Tiroglobulin  Alfa-laktalbumin
Albumini
Konalbumin  Ovalbumin  Avidin
Ljudski serumski albumin  Goveđi serumski albumin  Prealbumin
Drugi
C reaktivni protein  Laktalbumin (Alfa-laktalbumin)  Parvalbumin  Ricin
  • p
  • r
  • u
PDB Galerija
1e88: Rešenje strukture 6F11F22F2, kompaktni tri-modularni fragment želatin-vezanog domena ljudskog fibronektina
1e88: Rešenje strukture 6F11F22F2, kompaktni tri-modularni fragment želatin-vezanog domena ljudskog fibronektina  
1e8b: Rešenje strukture 6F11F22F2, kompaktni tri-modularni fragment želatin-vezanog domena ljudskog fibronektina
1e8b: Rešenje strukture 6F11F22F2, kompaktni tri-modularni fragment želatin-vezanog domena ljudskog fibronektina  
1fbr: Četvrti i peti fibronektin tip I par modula
1fbr: Četvrti i peti fibronektin tip I par modula  
1fna: Kristalna struktura desetog tip III ćelijskog adhezionog modula ljudskog fibronektina
1fna: Kristalna struktura desetog tip III ćelijskog adhezionog modula ljudskog fibronektina  
1fnf: Fragment ljudskog fibronektina koji sadrži tip-III ponavljanja 7 do 10
1fnf: Fragment ljudskog fibronektina koji sadrži tip-III ponavljanja 7 do 10  
1fnh: Kristalna struktura heparin i integrin vezujućeg segmenta ljudskog fibronektina
1fnh: Kristalna struktura heparin i integrin vezujućeg segmenta ljudskog fibronektina  
1j8k: NMR struktura fibronektin EDA domena, NMR, 20 struktura
1j8k: NMR struktura fibronektin EDA domena, NMR, 20 struktura  
1o9a: Rešenje strukture kompleksa 1F12F1 fibronektina sa B3 iz FNBB od S. DYSGALACTIAE
1o9a: Rešenje strukture kompleksa 1F12F1 fibronektina sa B3 iz FNBB od S. DYSGALACTIAE  
1oww: Rešenje strukture prvog tip III modula ljudskog fibronektina određena putem 1H, 15N NMR spektroskopije
1oww: Rešenje strukture prvog tip III modula ljudskog fibronektina određena putem 1H, 15N NMR spektroskopije  
1q38: Anastellin
1q38: Anastellin  
1qgb: Rešenje strukture N-terminal F1 para modula ljudskog fibronektina
1qgb: Rešenje strukture N-terminal F1 para modula ljudskog fibronektina  
1qo6: Rešenje strukture para modula iz želatin-vezujućeg domena fibronektina
1qo6: Rešenje strukture para modula iz želatin-vezujućeg domena fibronektina  
1ttf: 3D struktura desetog tip III modula fibronektina: uvid u RGD-posredovane interakcije
1ttf: 3D struktura desetog tip III modula fibronektina: uvid u RGD-posredovane interakcije  
1ttg: 3D struktura desetog tip III modula fibronektina: uvid u RGD-posredovane interakcije
1ttg: 3D struktura desetog tip III modula fibronektina: uvid u RGD-posredovane interakcije  
2cg6: Drugi i treći fibronektin tip I par modula (kristalna forma II)
2cg6: Drugi i treći fibronektin tip I par modula (kristalna forma II)  
2cg7: Drugi i treći fibronektin tip I par modula (kristalna forma II)
2cg7: Drugi i treći fibronektin tip I par modula (kristalna forma II)  
2cku: Rešenje strukture 2F13F1 ljudskog fibronektina
2cku: Rešenje strukture 2F13F1 ljudskog fibronektina  
2fn2: Rešenje strukture glukozilovanog drugog tipa II modula fibronektina, 20 struktura
2fn2: Rešenje strukture glukozilovanog drugog tipa II modula fibronektina, 20 struktura  
2fnb: NMR struktura fibronektin ED-B domena, NMR, 20 struktura
2fnb: NMR struktura fibronektin ED-B domena, NMR, 20 struktura  
2gee: Kristalna struktura ljudskog tip III fibronektina, ekstra domen B i domen 8
2gee: Kristalna struktura ljudskog tip III fibronektina, ekstra domen B i domen 8  
2h41: Rešenje strukture drugog tip III domena ljudskog fibronektina: minimizovana srednja struktura
2h41: Rešenje strukture drugog tip III domena ljudskog fibronektina: minimizovana srednja struktura  
2h45: Rešenje strukture drugog tip III domena ljudskog fibronektina: ansambl od 25 struktura
2h45: Rešenje strukture drugog tip III domena ljudskog fibronektina: ansambl od 25 struktura  
2ha1: Kompleks prvog i drugog tip III domena ljudskog Fibronektina u rastvoru
2ha1: Kompleks prvog i drugog tip III domena ljudskog Fibronektina u rastvoru