Peptidna veza

Peptidna veza
Glicinska kondenzacija

Peptidna veza (amidna veza) je kovalentna hemijska veza koji ase formira između dva molekula kad karboksilna grupa jednog molekula reaguje sa amino grupom drugog molekula, uz otpuštanje molekula vode (H2O). Ovaj proces je dehidraciona sintaza (takođe je poznata kao reakcija kondenzacije), i obično se javlja između aminokiselina. Rezultirajuća C(O)NH veza se naziva peptidna veza, dok je rezultirajući molekul amid. Funkcionalna grupa sa četiri atoma, -C(=O)NH-, se naziva peptidna veza. Polipeptidi i proteini su lanci aminokiselina povezanih peptidnim vezama, kao što je i PNA.

Dehidraciona sinteza (kondenzacija) amida

Peptidna veza se može raskinuti putem amidne hidrolize (dodatka vode). Proteinske peptidne veze su metastabilne, što znači da se u prisustvu vode one spontano razlažu, oslobađajući kJ/mol (2–4 kcal/mol)[1] slobodne energije, ali je ovaj proces veoma spor (do 1000 godina). U živim organizmima, proces posreduju enzimi. Živi organizmi takođe koriste enzime za formiranje peptidnih veza. Za taj proces je neophodna energija. Talasna dužina apsorbance za peptidnu vezu je 190–230 nm[2], što je čini veoma podložnom uticaju UV radijacije.

Reference

  1. Martin RB. (1998) "Free energies and equilibria of peptide bond hydrolysis and formation", Biopolymers, 45, 351–353.
  2. Goldfarb AR et al. (1951). „The Ultraviolet Absorption Spectra of Proteins”. J. Biological Chem. 193: 397–404. 

Literatura

  • Pauling L. (1960) The Nature of the Chemical Bond, 3rd. ed., Cornell University Press. ISBN 0-8014-0333-2
  • Stein RL. (1993) "Mechanism of Enzymatic and Nonenzymatic Prolyl cis-trans Isomerization", Adv. Protein Chem., 44, 1–24.
  • Schmid FX, Mayr LM, Mücke M and Schönbrunner ER. (1993) "Prolyl Isomerases: Role in Protein Folding", Adv. Protein Chem., 44, 25–66.
  • Fischer G. (1994) "Peptidyl-Prolyl cis/trans Isomerases and Their Effectors", Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 33, 1415–1436.

Vidi još

  • Mapa proteolize

Spoljašnje veze

Peptidna veza na Wikimedijinoj ostavi
  • p
  • r
  • u
Opšte
Peptidna veza  Biosinteza proteina  Proteoliza  Racemizacija  N-O acilno pomeranje
N-terminusC-terminusSpecifične
aminokiseline
Fosforilacija  Sulfacija  Vezivanje za porfirinski prsten  vezivanje flavina  formiranje p-hidroksibenziliden-imidazolona  formiranje Lizin tirozil kinona (LTQ)  formiranje topakinona (TPQ)
Formiranje sukcinimida
Formiranje diftamida

B bsyn: dnk (repl, cycl, reco, repr)  tscr (fact, tcrg, nucl, rnat, rept, ptts)  tltn (risu, pttl, nexn)  dnab, rnab/runp  stru (domn, 1°, 2°, 3°, 4°)
  • p
  • r
  • u
Intramolekulske
("jake")
Katjonska-pi veza  Sona veza
Intermolekulske
("slabe")
Van der Valsova sila  Londonova disperziona sila  Mehanička veza  Halogena veza  Zlatofilnost  Interkalacija  Steking  Sile entropije  Hemijska polarnost
Napomena: najslabije jake veze nisu neophodno jače od najjačih slabih veza