MEF2A

MEF2A
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1C7U, 1EGW, 1LEW, 3KOV, 3MU6, 3P57

Ідентифікатори
Символи MEF2A, ADCAD1, RSRFC4, RSRFC9, mef2, myocyte enhancer factor 2A
Зовнішні ІД OMIM: 600660 MGI: 99532 HomoloGene: 4080 GeneCards: MEF2A
Онтологія гена
Молекулярна функція

sequence-specific DNA binding
GO:0001105 transcription coactivator activity
DNA binding
protein dimerization activity
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
histone deacetylase binding
chromatin binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
histone acetyltransferase binding
protein heterodimerization activity
transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
SMAD binding
protein kinase binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

transcription regulator complex
нуклеоплазма
клітинне ядро
гіалоплазма

Біологічний процес

cellular response to calcium ion
диференціація клітин
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
mitochondrial genome maintenance
dendrite morphogenesis
positive regulation of muscle cell differentiation
muscle organ development
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription, DNA-templated
нейробіологія розвитку
ERK5 cascade
multicellular organism development
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
heart development
cardiac conduction
mitochondrion distribution
ventricular cardiac myofibril assembly
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0097285 апоптоз
positive regulation of cardiac muscle hypertrophy
transcription by RNA polymerase II
MAPK cascade
positive regulation of glucose import

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4205
17258
Ensembl
ENSG00000068305
ENSMUSG00000030557
UniProt
Q02078
Q60929
RefSeq (мРНК)
NM_001130926
NM_001130927
NM_001130928
NM_001171894
NM_005587
NM_001319206
NM_001352614
NM_001352615
NM_001352616
NM_001352617
NM_001352618
NM_001365201
NM_001365202
NM_001365203
NM_001365204
NM_001365205
NM_001365206
NM_001365207
NM_001365208
NM_001365209
NM_001365210
NM_001365211
NM_001393558
NM_001393559
NM_001393560
NM_001393561
NM_001033713
NM_001291191
NM_001291192
NM_001291195
NM_001291196
NM_001357324
NM_001357325
RefSeq (білок)
NP_001124398
NP_001124399
NP_001124400
NP_001165365
NP_001306135
NP_005578
NP_001339543
NP_001339544
NP_001339545
NP_001339546
NP_001339547
NP_001352130
NP_001352131
NP_001352132
NP_001352133
NP_001352134
NP_001352135
NP_001352136
NP_001352137
NP_001352138
NP_001352139
NP_001352140
NP_001028885
NP_001278120
NP_001278121
NP_001278124
NP_001278125
NP_001344253
NP_001344254
Локус (UCSC) Хр. 15: 99.57 – 99.72 Mb Хр. 7: 67.23 – 67.37 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

MEF2A (англ. Myocyte enhancer factor 2A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 507 амінокислот, а молекулярна маса — 54 811[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNS
SNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVEALNKKEHRGCDSPD
PDTSYVLTPHTEEKYKKINEEFDNMMRNHKIAPGLPPQNFSMSVTVPVTS
PNALSYTNPGSSLVSPSLAASSTLTDSSMLSPPQTTLHRNVSPGAPQRPP
STGNAGGMLSTTDLTVPNGAGSSPVGNGFVNSRASPNLIGATGANSLGKV
MPTKSPPPPGGGNLGMNSRKPDLRVVIPPSSKGMMPPLSEEEELELNTQR
ISSSQATQPLATPVVSVTTPSLPPQGLVYSAMPTAYNTDYSLTSADLSAL
QGFNSPGMLSLGQVSAWQQHHLGQAALSSLVAGGQLSQGSNLSINTNQNI
SIKSEPISPPRDRMTPSGFQQQQQQQQQQQPPPPPQPQPQPPQPQPRQEM
GRSPVDSLSSSSSSYDGSDREDPRGDFHSPIVLGRPPNTEDRESPSVKRM
RMDAWVT

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Pollock R., Treisman R. (1991). Human SRF-related proteins: DNA-binding properties and potential regulatory targets. Genes Dev. 5: 2327—2341. PMID 1748287 DOI:10.1101/gad.5.12a.2327
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Yang C.-C., Ornatsky O.I., McDermott J.C., Cruz T.F., Prody C.A. (1998). Interaction of myocyte enhancer factor 2 (MEF2) with a mitogen-activated protein kinase, ERK5/BMK1. Nucleic Acids Res. 26: 4771—4777. PMID 9753748 DOI:10.1093/nar/26.20.4771
  • Yang S.-H., Galanis A., Sharrocks A.D. (1999). Targeting of p38 mitogen-activated protein kinases to MEF2 transcription factors. Mol. Cell. Biol. 19: 4028—4038. PMID 10330143 DOI:10.1128/MCB.19.6.4028
  • Knight J.B., Eyster C.A., Griesel B.A., Olson A.L. (2003). Regulation of the human GLUT4 gene promoter: interaction between a transcriptional activator and myocyte enhancer factor 2A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 14725—14730. PMID 14630949 DOI:10.1073/pnas.2432756100
  • Zhu B., Ramachandran B., Gulick T. (2005). Alternative pre-mRNA splicing governs expression of a conserved acidic transactivation domain in myocyte enhancer factor 2 factors of striated muscle and brain. J. Biol. Chem. 280: 28749—28760. PMID 15834131 DOI:10.1074/jbc.M502491200

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6993 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  4. UniProt, Q02078 (англ.) . Архів оригіналу за 19 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 15
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші