ZC45病毒與ZXC21病毒

ZC45病毒與ZXC21病毒
病毒分類 编辑
（未分级）： 病毒 Virus
域： 核糖病毒域 Riboviria
界： 正核糖病毒界 Orthornavirae
门： 小核糖病毒门 Pisuviricota
纲： 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目： 套式病毒目 Nidovirales
科： 冠状病毒科 Coronaviridae
属： 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus
亚属： SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus
种：
SARSr-CoV
毒株：
ZC45病毒與ZXC21病毒 ZC45；ZXC21

ZC45病毒（SL-CoV ZC45）與ZXC21病毒（SL-CoV ZXC21），被部分媒體稱為舟山蝙蝠病毒[1]，皆為嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的病毒株，在中國浙江舟山的小菊頭蝠樣本中發現，於2018年發表。這兩個病毒株屬於SARS-CoV-2的演化支[2]，全基因組核酸序列與SARS-CoV-2的相似度約為88%[3][4]，與SARS-CoV的相似度則約為81%[5]。

發現

2015年至2017年間，研究人員在浙江舟山採集334隻小菊頭蝠樣本，發現其中含有多種冠狀病毒序列，其中有兩個新病毒株（即ZC45與ZXC21）的基因組被完整定序，分別長29802與29732nt，彼此基因組序列相似度為97%。這兩個病毒株的基因組序列與SARS-CoV相似度約為81%，刺突蛋白（S）胺基酸序列和SARS-CoV的相似度則為77%，皆低於Rs3367等數種較早發現的蝙蝠SARSr-CoV和SARS-CoV的相似度，且兩病毒刺突蛋白的S1次單元胺基酸序列和其他蝙蝠SARSr-CoV差異較大，與其相似度最高者（Rs806）亦僅有83%。動物實驗顯示ZC45病毒可感染實驗大鼠，在多個器官造成發炎，其中以腦組織最為明顯[5]。

與SARS-CoV-2的相似

2020年1月，2019冠狀病毒病疫情甫爆發後，研究人員定序SARS-CoV-2的基因組，發現ZC45與ZXC21是當時已知核酸序列與SARS-CoV-2相似度最高的病毒，約有88%[註 1]，高於SARS-CoV-2與SARS-CoV相似度的82%[2]，共同組成一演化支，不過兩病毒與與SARS-CoV-2在刺突蛋白的相似度較低，核酸序列的相似度約為75%，其中在S2次單元的相似度比S1次單元的高許多，在位於S1末端、與宿主細胞受體結合的受體結合結構域（receptor binding domain, RBD）相似度僅約60%，低於SARS-CoV-2與SARS-CoV在此的相似度（約74%）[4][6]。

爭議

2020年9月，前香港大學病毒學研究員閆麗夢在美國發表未經同行評審的論文，指控SARS-CoV-2並非自然產生，而是在實驗室經改造ZC45與ZXC21（或稱「舟山蝙蝠病毒」）而成的人造病毒，論文指出SARS-CoV-2基因組中的許多特徵不見於其他冠狀病毒，且ZC45與ZXC21的序列和其「十分相似」，很可能是製作SARS-CoV-2的來源模板，而與SARS-CoV-2關係接近、但在疫情爆發後才發表的RaTG13病毒、RmYN02病毒與穿山甲冠狀病毒可能為虛構[7][8]。此論文的可信度受到諸多學者批評[9]，許多病毒學家表示ZC45與ZXC21和SARS-CoV-2的序列差異大於10%，約有3500個鹼基不同，差異已大到幾乎不可能為人工製造[10]，有學者並形容此論文為垃圾科學[11]。

演化樹

SARS-CoV-2與相關病毒株的系統發生樹[12][13] :

 
 

Rc-o319 與SARS-CoV-2相似度81 % · 角菊頭蝠 · 日本岩手县 （2013年採集、2020年發表）[14]

 
 
 
 

SL-ZXC21 88 % · 小菊頭蝠 · 中华人民共和国浙江舟山（2015年採集、2018年發表）[5]

 
 

SL-ZC45 88 % · 小菊頭蝠 · 中華人民共和國浙江舟山（2017年採集、2018年發表）[5]

 
 
 
 

Pangolin-CoV-GX 85.5 % · 馬來穿山甲 · 东南亚 （2017年採集、2020年發表）[15]

 
 
 

Pangolin-CoV-GD 90.1 % · 馬來穿山甲 · 东南亚 （2019年採集、2020年發表）[16]

 
 
 
 

RshSTT182 92.6 % · 扁顱菊頭蝠（英语：Rhinolophus shameli） · 柬埔寨上丁省 （2010年採集、2021年發表）[13]

 
 

RshSTT200 92.6 % · 扁顱菊頭蝠 · 柬埔寨上丁省 （2010年採集、2021年發表）[13]

 
 
 
 

RacCS203（英语：RacCS203） 91.5 % · 大角菊头蝠（英语：Rhinolophus acuminatus） · 泰国差春騷府 （2020年採集、2021年發表）[12]

 
 

RmYN02 93.3 % · 馬來亞菊頭蝠 · 中華人民共和國雲南勐臘 （2019年採集、2020年發表）[4]

 
 
 
 

RaTG13 96.2 % · 中菊头蝠 · 中華人民共和國雲南墨江 （2013年採集、2020年發表）[17]

 
 

BANAL-52 96.8 % · 馬來亞菊頭蝠 · 寮國永珍省 （2020年採集、2022年發表）[18]

 
 

SARS-CoV-2 100 %

 
 
 
 
 
 
 
 

SARS-CoV 79%

 
  蝙蝠病毒
  穿山甲病毒
  人類病毒

註腳

  1. ^ 但後來發表的RaTG13病毒、RmYN02病毒等基因組與SARS-CoV-2的相似度更高，分別為96.2%與93.3%[4]。

參考文獻

  1. ^ 林祖偉. 肺炎疫情：新冠病毒到底哪來的？科學界的幾種說法. BBC中文. 2020-04-03 [2021-01-20]. （原始内容存档于2020-07-30）. 
  2. ^ 2.0 2.1 Jiang, Shibo; Du, Lanying; Shi, Zhengli. An emerging coronavirus causing pneumonia outbreak in Wuhan, China: calling for developing therapeutic and prophylactic strategies. Emerging Microbes & Infections. 2020, 9 (1): 275–277. ISSN 2222-1751. doi:10.1080/22221751.2020.1723441. 
  3. ^ Lau, Susanna K.P.; Luk, Hayes K.H.; Wong, Antonio C.P.; Li, Kenneth S.M.; Zhu, Longchao; He, Zirong; Fung, Joshua; Chan, Tony T.Y.; Fung, Kitty S.C.; Woo, Patrick C.Y. Possible Bat Origin of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2. Emerging Infectious Diseases. 2020, 26 (7): 1542–1547. ISSN 1080-6040. doi:10.3201/eid2607.200092. 
  4. ^ 4.0 4.1 4.2 4.3 Zhou, Hong; Chen, Xing; Hu, Tao; Li, Juan; Song, Hao; Liu, Yanran; Wang, Peihan; Liu, Di; Yang, Jing; Holmes, Edward C.; Hughes, Alice C.; Bi, Yuhai; Shi, Weifeng. A Novel Bat Coronavirus Closely Related to SARS-CoV-2 Contains Natural Insertions at the S1/S2 Cleavage Site of the Spike Protein. Current Biology. 2020, 30 (11): 2196–2203.e3. ISSN 0960-9822. doi:10.1016/j.cub.2020.05.023. 
  5. ^ 5.0 5.1 5.2 5.3 Hu, Dan; Zhu, Changqiang; Ai, Lele; He, Ting; Wang, Yi; Ye, Fuqiang; Yang, Lu; Ding, Chenxi; Zhu, Xuhui; Lv, Ruicheng; Zhu, Jin; Hassan, Bachar; Feng, Youjun; Tan, Weilong; Wang, Changjun. Genomic characterization and infectivity of a novel SARS-like coronavirus in Chinese bats. Emerging Microbes & Infections. 2018, 7 (1): 1–10. ISSN 2222-1751. doi:10.1038/s41426-018-0155-5. 
  6. ^ Lu, Roujian; Zhao, Xiang; Li, Juan; Niu, Peihua; Yang, Bo; Wu, Honglong; Wang, Wenling; Song, Hao; Huang, Baoying; Zhu, Na; Bi, Yuhai; Ma, Xuejun; Zhan, Faxian; Wang, Liang; Hu, Tao; Zhou, Hong; Hu, Zhenhong; Zhou, Weimin; Zhao, Li; Chen, Jing; Meng, Yao; Wang, Ji; Lin, Yang; Yuan, Jianying; Xie, Zhihao; Ma, Jinmin; Liu, William J; Wang, Dayan; Xu, Wenbo; Holmes, Edward C; Gao, George F; Wu, Guizhen; Chen, Weijun; Shi, Weifeng; Tan, Wenjie. Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. The Lancet. 2020, 395 (10224): 565–574. ISSN 0140-6736. doi:10.1016/S0140-6736(20)30251-8. 
  7. ^ Yan, Li-Meng; Kang, Shu; Guan, Jie; Hu, Shanchang. Unusual Features of the SARS-CoV-2 Genome Suggesting Sophisticated Laboratory Modification Rather Than Natural Evolution and Delineation of Its Probable Synthetic Route. Rule of Law Society & Rule of Law Foundation. [2021-01-20]. （原始内容存档于2020-09-15）. 
  8. ^ Keoni Everington. Virologist releases paper claiming coronavirus made in Chinese lab. Taiwan News. 2020-09-15 [2021-01-20]. （原始内容存档于2021-01-15）. 
  9. ^ Katherine J. Wu. Another ‘Unfounded’ Study on Origins of Virus Spreads Online. The New York Times. 2020-10-13 [2021-01-20]. （原始内容存档于2020-11-02）. 
  10. ^ Brouillette, Monique; Renner, Rebecca. Why misinformation about COVID-19's origins keeps going viral: Another piece of coronavirus misinformation is making the rounds. Here's how to sift through the muck.. National Geographic. 2020-09-18 [2021-01-20]. （原始内容存档于2020-09-24）. 
  11. ^ Kuznia, Rob; Bronstein, Scott; Griffin, Drew; Devine, Curt. How a Covid-19 origin theory backed by Bannon unraveled - CNNPolitics. CNN. 2020-10-21 [2020-10-22]. （原始内容存档于2022-05-03）. 
  12. ^ 12.0 12.1 Wacharapluesadee S, Tan CW, Maneeorn P, Duengkae P, Zhu F, Joyjinda Y, et al. Evidence for SARS-CoV-2 related coronaviruses circulating in bats and pangolins in Southeast Asia. Nature Communications. February 2021, 12 (1): 972. PMC 7873279 可免费查阅. PMID 33563978. doi:10.1038/s41467-021-21240-1 可免费查阅. 
  13. ^ 13.0 13.1 13.2 Hul V, Delaune D, Karlsson EA, Hassanin A, Tey PO, Baidaliuk A, et al. A novel SARS-CoV-2 related coronavirus in bats from Cambodia. bioRxiv: 2021.01.26.428212. 26 January 2021. doi:10.1101/2021.01.26.428212 （英语）. 
  14. ^ Murakami, Shin; Kitamura, Tomoya; Suzuki, Jin; Sato, Ryouta; Aoi, Toshiki; Fujii, Marina; Matsugo, Hiromichi; Kamiki, Haruhiko; Ishida, Hiroho; Takenaka-Uema, Akiko; Shimojima, Masayuki; Horimoto, Taisuke. Detection and Characterization of Bat Sarbecovirus Phylogenetically Related to SARS-CoV-2, Japan. Emerging Infectious Diseases. 2020, 26 (12): 3025–3029. ISSN 1080-6040. doi:10.3201/eid2612.203386. 
  15. ^ Lam, Tommy Tsan-Yuk; et al. Identifying SARS-CoV-2-related coronaviruses in Malayan pangolins. Nature. 2020, 583 (7815): 282–285. ISSN 0028-0836. doi:10.1038/s41586-020-2169-0. 
  16. ^ Xiao, Kangpeng; Zhai, Junqiong; Feng, Yaoyu; Zhou, Niu; Zhang, Xu; Zou, Jie-Jian; Li, Na; Guo, Yaqiong; Li, Xiaobing; Shen, Xuejuan; Zhang, Zhipeng; Shu, Fanfan; Huang, Wanyi; Li, Yu; Zhang, Ziding; Chen, Rui-Ai; Wu, Ya-Jiang; Peng, Shi-Ming; Huang, Mian; Xie, Wei-Jun; Cai, Qin-Hui; Hou, Fang-Hui; Chen, Wu; Xiao, Lihua; Shen, Yongyi. Isolation of SARS-CoV-2-related coronavirus from Malayan pangolins. Nature. 2020-07-09, 583 (7815): 286–289. doi:10.1038/s41586-020-2313-x. 
  17. ^ Zhou, Peng; Yang, Xing-Lou; Wang, Xian-Guang; Hu, Ben; Zhang, Lei; Zhang, Wei; Si, Hao-Rui; Zhu, Yan; et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature. 2020, 579 (7798): 270–273. ISSN 0028-0836. doi:10.1038/s41586-020-2012-7. 
  18. ^ Temmam, Sarah; Vongphayloth, Khamsing; Baquero, Eduard; Munier, Sandie; Bonomi, Massimiliano; Regnault, Béatrice; Douangboubpha, Bounsavane; Karami, Yasaman; Chrétien, Delphine; Sanamxay, Daosavanh; Xayaphet, Vilakhan; Paphaphanh, Phetphoumin; Lacoste, Vincent; Somlor, Somphavanh; Lakeomany, Khaithong; Phommavanh, Nothasin; Pérot, Philippe; Dehan, Océane; Amara, Faustine; Donati, Flora; Bigot, Thomas; Nilges, Michael; Rey, Félix A.; van der Werf, Sylvie; Brey, Paul T.; Eloit, Marc. Bat coronaviruses related to SARS-CoV-2 and infectious for human cells. Nature. 16 February 2022. doi:10.1038/s41586-022-04532-4. 
  • 查
  • 论
  • 编
 
甲型冠狀病毒屬
（α-CoV）
甲型冠狀病毒1型
甲型冠狀病毒2型
雪貂冠狀病毒（FRECV · FRSCV） · 水鼬冠狀病毒（MCoV）
229E病毒
人類冠狀病毒229E（HCoV-229E） · 羊駝冠狀病毒（ACoV） · 單峰駱駝229E樣冠狀病毒 · 蝙蝠229E樣冠狀病毒
NL63病毒
人類冠狀病毒NL63（HCoV-NL63） · NL63相關蝙蝠冠狀病毒（英语：NL63-related bat coronavirus strain BtKYNL63-9b）
長翼蝠冠狀病毒HKU8（Bat-CoV HKU8） · 長翼蝠冠狀病毒1型（Bat-CoV 1A/1B） · 褐扁顱蝠冠狀病毒HKU33（Tr-BatCoV HKU33）
蝙蝠冠狀病毒HKU10（Bat-CoV HKU10） · 马铁菊头蝠甲型冠状病毒HuB-2013（英语：Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB-2013） · 中華菊頭蝠冠狀病毒HKU32（Rs-BatCoV HKU32） · 蝙蝠冠狀病毒CDPHE15（BatCoV CDPHE15） · 高頭蝠冠狀病毒512（Sc-BatCoV-512） · 猪流行性腹泻病毒（PEDV）
其他
鼩鼱冠狀病毒T14（Sa-CoV T14） · 文成鼩鼱病毒（WESV） · 鹿城褐家鼠冠状病毒（LRNV）
乙型冠狀病毒屬
（β-CoV）
Embecovirus（英语：Embecovirus）
（支系A）
乙型冠狀病毒1型（β1CoV）
牛冠狀病毒（BCoV） · 人類冠狀病毒OC43（HCoV-OC43） · 馬冠狀病毒（ECoV） · 豬凝血性腦脊髓炎病毒（PHEV） · 犬呼吸道冠狀病毒（CRCoV）
兔冠狀病毒HKU14（RbCoV HKU14） · 黃鼠冠狀病毒HKU24（ChRCoV HKU24） · 龍泉黑線姬鼠冠狀病毒（LAMV）
鼠冠狀病毒（M-CoV）
鼠肝炎病毒（MHV） · 大鼠冠狀病毒（RCoV）（大鼠涎淚腺炎病毒SDAV · 帕克RCoV）
人類冠狀病毒HKU1（HCoV-HKU1） · 龍泉羅賽鼠冠狀病毒（LRLV）
Merbecovirus（英语：Merbecovirus）
（支系C）
刺蝟冠狀病毒（EriCoV） · 東北刺蝟冠狀病毒HKU31（Ea-HedCoV HKU31） · 扁颅蝠冠状病毒HKU4（Bat-CoV HKU4） · 伏翼蝠冠状病毒HKU5（Bat-CoV HKU5） · 中東呼吸綜合症冠狀病毒（MERS-CoV） · 祖魯棕蝠冠狀病毒（NeoCoV） · 灰伏翼冠狀病毒HKU25（Hp-BatCoV HKU25）
Nobecovirus（英语：Nobecovirus）（支系D）
果蝠冠状病毒GCCDC1（Ro-BatCoV GCCDC1） · 果蝠冠状病毒HKU9（Ro-BatCoV HKU9）
Hibecovirus（英语：Hibecovirus）                            
普氏蹄蝠冠狀病毒ZJ013（BtHp-BetaCoV/ZJ2013）
Sarbecovirus（支系B）                            
SARS-CoV-1 · SARS-CoV-2 · 变种 · 蝙蝠SARSr-CoV（詳见Template:SARSr-CoV）
丙型冠状病毒属
（γ-CoV）
Cegacovirus
鯨豚冠狀病毒（白鯨冠狀病毒SW1 · 瓶鼻海豚冠狀病毒HKU22）
Brangacovirus（英语：Brangacovirus）
Igacovirus（英语：Igacovirus）
禽冠狀病毒（傳染性支氣管炎病毒） · 禽冠狀病毒9203（火雞冠狀病毒）
丁型冠狀病毒屬
（δ-CoV）
鵯冠狀病毒HKU11（BuCoV HKU11） · 鶇冠狀病毒HKU12（ThCoV HKU12） · 文鳥冠狀病毒HKU13（英语：Munia coronavirus HKU13）（MuCoV HKU13） · 猪丁型冠状病毒（PdCV） · 繡眼冠狀病毒HKU16（英语：White-eye coronavirus HKU16）（WeCoV HKU16） · 麻雀冠狀病毒HKU17（SpCoV HKU17） · 鵲鴝冠狀病毒HKU18（MRCoV HKU18） · 夜鷺冠狀病毒HKU19 · 鴨冠狀病毒HKU20（WiCoV HKU20） · 紅冠水雞冠狀病毒HKU21（英语：Common moorhen coronavirus HKU21）（CMCoV HKU21） · 隼冠狀病毒HKU27（FalCoV UAE-HKU27） · 翎頜鴇冠狀病毒HKU28（HouCoV UAE-HKU28） · 鴿冠狀病毒HKU29（PiCoV UAE-HKU29） · 鵪鶉冠狀病毒HKU30（QuaCoV UAE-HKU30）
 
  • 查
  • 论
  • 编
SARSr-CoV
SARS-CoV-1相關病毒
人類病毒
蝙蝠病毒
HKU3 · Rm1 · Rf1 · Rp3 · Rs672 · SHC014 · WIV1 · LYRa11 · YNLF 31C · YNLF 34C · WIV16 · 16BO133
其他
SARS-CoV-2相關病毒
人類病毒
變異株
需要关注的变异株（英语：SARS-CoV-2 variant of concern）（VOC）
Omicron（B.1.1.529）
子谱系：BA.1、BA.1.1、BA.2、BA.2.10.1、BA.2.12、BA.2.12.1、BA.2.75、BA.2.75.2、BA.2.86、BA.3、BA.4、BA.5、BA.5.2.1、BF.7、BQ.1、BQ.1.1、CH.1.1、EG.5、EG.5.1、JN.1、XBB、XBB.1、XBB.1.5、XBB.1.9.2、XBB.1.16、XBF、XE（西班牙语：Variante XE del SARS-CoV-2）
原需要关注的变异株
Alpha（B.1.1.7）（带E484K版本）（書面挪威語：Lineage B.1.1.7 with E484K） · Beta（B.1.351） · Gamma（P.1） · Delta（B.1.617.2）
原需要留意的变异株（阿拉伯语：متحور مثير للاهتمام）（VOI）
及监视下的变异株（阿拉伯语：متحور قيد المراقبة）（VUM）
Zeta（英语：SARS-CoV-2 Zeta variant）（P.2） · Theta（英语：SARS-CoV-2 Theta variant）（P.3） · Epsilon（英语：SARS-CoV-2 Epsilon variant）（B.1.427、B.1.429（書面挪威語：Lineage B.1.429）、CAL.20C） · Kappa（B.1.617.1） · Iota（英语：SARS-CoV-2 Iota variant）（B.1.526） · Eta（英语：SARS-CoV-2 Eta variant）（B.1.525） · Lambda（C.37） · Mu（B.1.621）
曾監視的變異株（FMV）
AV.1 · AT.1 · R.1（西班牙语：Variante R.1 del SARS-CoV-2） · B.1.466.2 · B.1.1.519 · C.36.3 · B.1.214.2 · B.1.1.523（西班牙语：B.1.1.523） · B.1.619 · B.1.620（書面挪威語：Lineage B.1.620） · B.1.1.318（書面挪威語：Lineage B.1.1.318）/AZ.5 · C.1.2（他加禄语：SARS-CoV-2 Lineage C.1.2） · B.1.630 · B.1.640 · XD
其他变种
B.1.1.207（書面挪威語：Lineage B.1.1.207） · B.1.1.317 · B.1.616（書面挪威語：Den bretonske koronavarianten） · B.1.618（書面挪威語：Lineage B.1.618） · B.1.640.2（德语：B.1.640.2） · Deltacron（書面挪威語：«Deltacron»） · XF · Cluster 5（英语：Cluster 5）（已消亡）
错义突变
del 69-70 · RSYLTPGD246-253N · N440K · G446V · L452R（書面挪威語：Mutasjon L452R） · Y453F · S477G/N · E484Q（書面挪威語：Mutasjon E484Q） · E484K（書面挪威語：Mutasjon E484K） · F490S · N501Y（書面挪威語：Mutasjon N501Y） · N501S · D614G（書面挪威語：Mutasjon D614G） · Q677P/H · P681H（書面挪威語：Mutasjon P681H） · P681R（書面挪威語：Mutasjon P681R） · A701V（書面挪威語：Mutasjon A701B og mutasjon A701V）
蝙蝠病毒
RaTG13 · RmYN02 · RacCS203（英语：RacCS203） · RshSTT182 · RshSTT200 · ZC45 · ZXC21 · Rc-o319
其他
穿山甲冠狀病毒（GD · GX · Pangolin-CoV-2020）
其他
相關病毒
Ghana348相關 · HKU9 · BtKY18樣 · BtHp-BetaCoV/ZJ2013
  • 病毒主题
  • 2019冠状病毒病主题