Transmembranski receptor

Sedam-transmembranska α-heliksna struktura G-protein-spregnutog receptora.

Membranski ili transmembranski receptori su specijalizovani integralni membranski proteini koji učestvuju u komunikaciji između ćelije i spoljašnjeg sveta. Ekstracelularni signalni molekuli (obično hormoni, neurotransmiteri, citokini, faktori rasta ili ćelijski adhezivni molekuli) se vezuju za receptor, inicirajući promene funkcije ćelije. Ovaj proces se naziva transdukcija signala: Vezivanje inicira hemijsku promenu na intracelularnoj strani membrane. Na taj način receptori igraju jedinstvenu i važnu ulogu u ćelijskog komunikaciji i transdukciji signala.

Mnogi transmembranski receptori se sastoje od dve ili više proteinskih podjedinica koje operišu kolektivno i mogu da se disociraju kad se ligandi vežu. Oni su često klasifikovani na osnovu njihove molekulske strukture, ili pošto je detaljna struktura nepoznata za veliku većinu receptora, na osnovu njihove hipotetične (i u pojedinim slučajevima eksperimentalno potvrđene) membranske topologije. Za polipeptidne lance se smatra da premoštavaju lipidni dvosloj samo jednom, dok drugi imaju i po sedam transmembranskih domena (na primer G-protein spregnuti receptori).

Primeri membranskih proteina su glikoproteini i lipoproteini.[1] Stotine membranskih receptora je poznato, a mnogi receptori još nisu otkriveni.[2][3] Skoro svi poznati membranski receptori su transmembranski proteini. Pojedine membrane mogu da imaju nekoliko membranskih receptora sa različitom zastupljenošću na svojoj površini. Pojedini receptori mogu da imaju različite koncentracije na različitim membranskim površinama u zavisnosti od membrane i ćelijske funkcije. Za receptore je uobičajeno da formiraju klastere na površini membrane[4][5], tako da je distribucija receptora na membranskoj površini uglavnom heterogena.

Domeni

E = ekstracelularni prostor
P = membrana plazme
I = intracelularni prostor

Kao i svaki drugi integralni membranski protein, transmembranski receptor može da bude segmentiran u tri dela ili domena.


Ekstracelularni domen

Ekstracelularni domen je deo receptora izvan membrane na spoljašnjoj strani ćelije ili organele. Ako polipeptidni lanac receptora premoštava dvosloj nekoliko puta, spoljašnji domen se može sastojati od nekoliko "petlji" koje vire izvan membrane. Po definiciji, glavna funkcija receptora je da prepoznaje i proizvodi respons na specifični ligand, na primer neurotransmiter ili hormon (mada pojedini receptori odgovaraju takođe na promene u transmembranskom potencijalu), i u mnogim receptorima ligandi se vezuju za ekstracelularni domen.

Transmembranski domen

Glavni članak: Transmembranski domen

Kod većine receptora transmembranski alfa heliksi sačinjavaju najveći deo transmembranskog domena. Kod određenih receptora, poput nikotinskog acetilholin receptora, transmembranski domen formira proteinom-okruženu poru kroz membranu, ili jonski kanal. Nakon aktivacije ekstracelularnog domena vezivanjem odgovarajućeg liganda, pora postaje dostupna za jone, koji prolaze kroz nju. Kod drugih receptora, smatra se da transmembranski domeni podležu konformacionoj promeni nakon vezivanja, što uzrokuje intracelularne efekte. Kod nekih receptora, poput članova 7TM superfamilije, transmembranski domen može da sadrži ligand-vezujuće mesto (evidencija za to i za većinu drugih informacija o ovoj klasi receptora je zasnovana delom na studijama bakteriorodopsina i par drugih receptora klase A, čija struktura je bila određena kristalografski).

Intracelularni domen

Intracelularni (ili citoplazmatični) domen receptora interaguje sa unutrašnjošću ćelije ili organele, i prenosi signal. Postoje dva fundamentalno različita načina za ostvarivanje interakcije:

  • Intracelularni domen komunicira putem specifičnih protein-protein interakcija sa efektorskim proteinima, koji prenose signal duž signalnog lanca do njegove destinacije.
  • Kod enzim-vezanih receptora, intracelularni domen poseduje enzimatsku aktivnost. To je često aktivnost tirozin kinaze. Enzimatska aktivnost može takođe da bude locirana na enzimu vezanom za intracelularni domen.

Vidi još

Literatura

  1. Cuatrecasas P. (1974). „MEMBRANE RECEPTORS”. Annual Review of Biochemistry 43 (0): 169–214. DOI:10.1146/annurev.bi.43.070174.001125. PMID 4368906. 
  2. Dautzenberg FM, Hauger RL (February 2002). „The CRF peptide family and their receptors: yet more partners discovered”. Trends Pharmacol. Sci. 23 (2): 71–7. PMID 11830263. 
  3. Rivière S, Challet L, Fluegge D, Spehr M, Rodriguez I (May 2009). „Formyl peptide receptor-like proteins are a novel family of vomeronasal chemosensors”. Nature 459 (7246): 574–7. DOI:10.1038/nature08029. PMID 19387439. 
  4. Rothberg K.G.,Ying Y.S.,Kamen B.A.,Anderson R.G. (1990). „Cholesterol controls the clustering of the glycophospholipid-anchored membrane receptor for 5-methyltetrahydrofolate”. The Journal of Cell Biology 111 (6): 2931–2938. DOI:10.1083/jcb.111.6.2931. PMC 2116385. PMID 2148564. 
  5. Jacobson C.,Côté P.D.,Rossi S.G.,Rotundo R.L.,Carbonetto S. (2001). „The Dystroglycan Complex Is Necessary for Stabilization of Acetylcholine Receptor Clusters at Neuromuscular Junctions and Formation of the Synaptic Basement Membrane”. The Journal of Cell Biology 152 (3): 435–450. DOI:10.1083/jcb.152.3.435. PMC 2195998. PMID 11157973. 

Spoljašnje veze

  • p
  • r
  • u
Ključni koncepti
Transdukcija signala • Apoptoza • Sistemi sekundarnih glasnika (Ca2+ signalizacija, Lipidna signalizacija, Kvorum očitavanje)
Procesi
Parakrini • Autokrini • Jukstakrini • Neurotransmiteri • Endokrini (Neuroendokrini) • Intrakrini
Signalni putevi
Hedgehog signalni put • Wnt signalni put • TGF beta signalni put • MAPK/ERK put • Notch signalni put • JAK-STAT signalni put • cAMP zavisni put • Akt/PKB signalni put • Fas apoptozni signalni put • Hippo signalni put • IP3/DAG put
Agensi
Ligandi
Receptor
Generalni • Preinicijacioni kompleks • TFIID, TFIIH
Drugi
Adapter protein • Protein osnove
  • p
  • r
  • u
Signalni putevi
G protein-spregnuti receptor (Hedgehog, Wnt)  RTK (TGF beta, MAPK/ERK Notch  JAK-STAT  Akt/PKB  Fas apoptoza  Hippo  PI3K/AKT/mTOR put  Integrinski receptori
Agensi
Receptorski ligandi
Receptori
Ćelijska površina  Intracelularni  Co-receptori
Intracelularna signalizacija
Signal provodeći adapterski protein: Gradivni protein
Drugi glasnik: cAMP-zavisni put  Ca2+ signalizacija  Lipidna signalizacija  IP3/DAG put
Generalni  Transkripcioni preinicijacioni kompleks  TFIID, TFIIH
Po lokaciji
Intrakrina  Autokrina  Jukstakrina  Parakrina  Endokrina
Drugi koncepti
Signalni molekul  Jonski kanal  Mehanotransdukcija  Fototransdukcija  Sinaptička transmisija
B trdu: peptidi (nrpl/grfl/cytl/horl), receptori (lgic, enzr, gprc, igsr, intg, nrpr/grfr/cytr), itra (adap, gbpr, mapk), calc, lipd, signalni putevi (hedp, wntp, tgfp+mapp, notp, jakp, fsap, hipp, tlrp)
  • p
  • r
  • u
Transmembranski receptor: G protein spregnuti receptori
Klasa A: Rodopsinu slični
α1 (A, B, D) • α2 (A, B, C) • β1 • β2 • β3
Adenozinski (A1, A2A, A2B, A3) • P2Y (1, 2, 4, 5, 6, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14)
(svi osim 5-HT3) 5-HT1 (A, B, D, E, F) • 5-HT2 (A, B, C) • 5-HT (4, 5A, 6, 7)
Drugi
Acetilholin (M1, M2, M3, M4, M5) • Dopamin (D1, D2, D3, D4, D5) • Histamin (H1, H2, H3, H4) • Melatonin (1A, 1B, 1C) • TAAR (1, 2, 3, 5, 6, 8, 9)
Metaboliti i
signalni molekuli
CysLT (1, 2) • LTB4 (1, 2) • FPRL1 • OXE • Prostaglandin (DP (1, 2), EP (1, 2, 3, 4), FP) • Prostaciklin • Tromboksan
Drugi
Žučna kiselina • Kanabinoidni (CB1, CB2, GPR (18, 55, 119)) • EBI2 • Estrogen • Slobodna masna kiselina (1, 2, 3, 4) • Laktat  • Lizofosfatidna kiselina (1, 2, 3, 4, 5, 6)  • Lizofosfolipid (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8) • Niacin (1, 2) • Oksoglutarat • PAF • Sfingozin-1-fosfat (1, 2, 3, 4, 5) • Sukcinat
Peptid
B/W (1, 2) • FF (1, 2) • S • Y (1, 2, 4, 5) • Neuromedin (B, U (1, 2)) • Neurotenzin (1, 2)
Drugi
Anafilatoksin (C3a, C5a) • Angiotenzin (1, 2) • Apelin • Bombezin (BRS3, GRPR, NMBR) • Bradikinin (B1, B2) • Hemokin • Holecistokinin (A, B) • Endotelin (A, B) • Formil peptid (1, 2, 3) • FSH • Galanin (1, 2, 3) • GHB receptor • Gonadotropin-oslobađajući hormon (1, 2) • Grelin • Kispeptin • Luteinizirajući hormon/horiogonadotropin • MAS (1, 1L, D, E, F, G, X1, X2, X3, X4) • Melanokortin (1, 2, 3, 4, 5) • MCHR (1, 2) • Motilin • Opioidni (δ, κ, μ, Nociceptin & ζ, ali ne σ) • Oreksin (1, 2) • Oksitocin • Prokineticin (1, 2) • Prolaktin-oslobađajući peptid • Relaksin (1, 2, 3, 4) • Somatostatin (1, 2, 3, 4, 5) • Tahikinin (1, 2, 3) • Tirotropin • Tirotropin-oslobađajući hormon • Urotenzin-II • Vazopresin (1A, 1B, 2)
Razno
GPR (1, 3, 4, 6, 12, 15, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 25, 26, 27, 31, 32, 33, 34, 35, 37, 39, 42, 44, 45, 50, 52, 55, 61, 62, 63, 65, 68, 75, 77, 78, 81, 82, 83, 84, 85, 87, 88, 92, 101, 103, 109A, 109B, 119, 120, 132, 135, 137B, 139, 141, 142, 146, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 160, 161, 162, 171, 173, 174, 176, 177, 182, 183)
Drugi
Adrenomedulin • Mirisni • Opsin (3, 4, 5, 1LW, 1MW, 1SW, RGR, RRH) • Proteazom-aktivirani (1, 2, 3, 4) • SREB (1, 2, 3)
Klasa B: Sekretinu slični
GPR (56, 64, 97, 98, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 123, 124, 125, 126, 128, 133, 143, 144, 155, 157)
Drugi
Klasa C: Metabotropni
glutamat / feromon
TAS1R (1, 2, 3) • TAS2R (1, 3, 4, 5, 8, 9, 10, 12, 13, 14, 16, 19, 20, 30, 31, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 45, 46, 50)
Drugi
Klasa F:
Frizzled / Zaglađeni
Uvojiti
Frizzled (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10)
Zaglađeni
B trdu: peptidi (nrpl/grfl/cytl/horl), receptori (lgic, enzr, gprc, igsr, intg, nrpr/grfr/cytr), itra (adap, gbpr, mapk), calc, lipd, signalni putevi (hedp, wntp, tgfp+mapp, notp, jakp, fsap, hipp, tlrp)
  • p
  • r
  • u
  • p
  • r
  • u
Receptori faktora rasta
EGFR • ERBB2 • ERBB3 • ERBB4
IGF1R • INSR • INSRR
CSF1R • FLT3 • KIT • PDGFR (PDGFRA, PDGFRB)
FGFR1 • FGFR2 • FGFR3 • FGFR4
VEGFR1 • VEGFR2 • VEGFR3 • VEGFR4
MET • RON
NTRK1 • NTRK2 • NTRK3
EPH receptorska familija
EPHA1 • EPHA2 • EPHA3 • EPHA4 • EPHA5 • EPHA6 • EPHA7 • EPHA8 • EPHB1 • EPHB2 • EPHB3 • EPHB4 • EPHB5 • EPHB6 • EPHX
LTK receptorska familija
LTK • ALK
TIE receptorska familija
TIE • TEK
ROR receptorska familija
ROR1 • ROR2
DDR receptorska familija
DDR1 • DDR2
PTK7 receptorska familija
RYK receptorska familija
MuSK receptorska familija
ROS receptorska familija
ROS1
AATYK receptorska familija
AATYK • AATYK2 • AATYK3
AXL receptorska familija
AXL • MER • TYRO3
RET receptorska familija
nekategorisani
  • p
  • r
  • u
ABL familija
ABL1 • ARG
ACK familija
ACK1 • TNK1
CSK familija
CSK • MATK
FAK familija
FAK • PYK2
FES familija
FES • FER
FRK familija
FRK • BRK • SRMS
JAK familija
JAK1 • JAK2 • JAK3 • TYK2
SRC-A familija
SRC • FGR • FYN • YES1
SRC-B familija
BLK • HCK • LCK • LYN
TEC familija
TEC • BMX • BTK • ITK • TXK
SYK familija
SYK • ZAP70
B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6
  • p
  • r
  • u
Receptori za antitela:
Fc receptor
Epsilon (ε)
FcεRI  (FcεRII je C-tip lektin)
Gama (γ)
FcγRI • FcγRII • FcγRIII • Neonatalni
Alfa (α)/mu (μ)
FcαRI  Fcα/μR
Sekretorni
Polimerni imunoglobulinski receptor
Receptori za antigene
B ćelije
Antigenski receptor
BCR
Koreceptori
stimuliše: CD21/CD19/CD81
inhibira: CD22
Pomoćni molekuli
Ig-α/Ig-β (CD79)
T ćelije
Ligandi
MHC (MHC klasa I i MHC klasa II)
Antigenski receptor
TCR: TRA@  TRB@  TRD@  TRG@
Koreceptori
CD8 (sa dva glikoproteinska lanca CD8α i CD8β)  CD4
Pomoćni molekuli
CD3  CD3γ  CD3δ  CD3ε  ζ-lanac (CD3ζ i TCRζ)
Citokinski receptor
Pogledajte citokinski receptori
Receptori ćelija ubica slični IG
KIR2DL1, KIR2DL2, KIR2DL3, KIR2DL4, KIR2DL5A, KIR2DL5B, KIR2DS1, KIR2DS2, KIR2DS3, KIR2DS4, KIR2DS5, KIR3DL1, KIR3DL2, KIR3DL3, KIR3DS1
Leukocitni receptori slični IG
LILRA1  LILRA2  LILRA3  LILRA4  LILRA5  LILRA6  LILRB1  LILRB2  LILRB3  LILRB4  LILRB5  LILRA6  LILRA5
B trdu: peptidi (nrpl/grfl/cytl/horl), receptori (lgic, enzr, gprc, igsr, intg, nrpr/grfr/cytr), itra (adap, gbpr, mapk), calc, lipd, signalni putevi (hedp, wntp, tgfp+mapp, notp, jakp, fsap, hipp, tlrp)

M: LMC

ćelije/fis/auag/auab

imdf/ipig/hyps/tumr

proc, lek (L3/4)

  • p
  • r
  • u
Transmembranski protein
Transmembranski receptori (CD33)
Periferni membrane protein
Lipid ankerisani protein
Pora-formirajući toksin
antimikrobni katjonski peptid (Catelicidin, Cecropin, Defensin, Dermcidin, Histatin, Magainin, Meliten, Polimiksin, Tionin Bacteriocin  Gramicidin (Gramicidin S Hemolizin  Leukocidin  Perforin  Streptolizin
Transfer/transport
Proteini membranskog transporta  Proteini fosfolipid transfer  Proteini vesikularnog transporta
Citoskeleton
Ankirin  Distrofin  Spektrin  Utrofin
Negrupisani
Arestin  Kalneksin  Koneksin  Efrin  Heterotrimerni GTP-vezujući proteini  LRPAP1 protein  Membranski fuzioni protein (VAMP)  Mijelin bazni protein  Neurofibromin 2  Presenilin (PSEN1, PSEN2)  Protoporfirinogen oksidaza  Plućni surfaktant (Plućni surfaktant-vezani protein B, plućni surfaktant-vezani protein C)  Tetraspanin  Peroksin